281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2869 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2869  outer membrane usher protein  100 
 
 
403 aa  821    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  96.42 
 
 
890 aa  765    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  96.68 
 
 
833 aa  766    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  36.96 
 
 
939 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.6 
 
 
930 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  36.68 
 
 
913 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  36.43 
 
 
914 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  36.43 
 
 
914 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.23 
 
 
856 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.68 
 
 
884 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.28 
 
 
887 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.33 
 
 
866 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  28.88 
 
 
872 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  31.23 
 
 
901 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.23 
 
 
901 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  28.2 
 
 
868 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.87 
 
 
880 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  32.8 
 
 
866 aa  155  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  32.8 
 
 
866 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.8 
 
 
865 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  32.8 
 
 
861 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.71 
 
 
886 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  31.04 
 
 
842 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.71 
 
 
1040 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.79 
 
 
850 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  30.83 
 
 
844 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.12 
 
 
852 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.68 
 
 
872 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.84 
 
 
867 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  30.43 
 
 
853 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  30.43 
 
 
853 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  30.43 
 
 
853 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  30.43 
 
 
853 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  30.43 
 
 
853 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.25 
 
 
880 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  30.79 
 
 
865 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.71 
 
 
850 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  27.08 
 
 
854 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.08 
 
 
863 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  27.08 
 
 
854 aa  143  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.84 
 
 
883 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  31.4 
 
 
888 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.61 
 
 
861 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  29.32 
 
 
883 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.76 
 
 
864 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.37 
 
 
929 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  29.49 
 
 
866 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.49 
 
 
871 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.17 
 
 
870 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  29.17 
 
 
870 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.34 
 
 
852 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.48 
 
 
819 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0323635 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.75 
 
 
838 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.43 
 
 
837 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0292471 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  29.46 
 
 
838 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.14 
 
 
963 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  29.46 
 
 
838 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  30.03 
 
 
863 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  29.46 
 
 
838 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  29.46 
 
 
838 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.03 
 
 
838 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  30.36 
 
 
866 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3974  putative outer membrane usher protein  27.22 
 
 
866 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.183336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  27.98 
 
 
866 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  28.27 
 
 
875 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  31.11 
 
 
837 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2339  fimbrial usher protein  28.93 
 
 
828 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.365526  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2496  fimbrial usher protein  28.93 
 
 
828 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.775864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4155  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.85 
 
 
836 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2388  fimbrial usher protein  28.65 
 
 
828 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  27.61 
 
 
856 aa  122  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  27.61 
 
 
878 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  27.61 
 
 
878 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.61 
 
 
878 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.73 
 
 
851 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.11 
 
 
837 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  27.33 
 
 
878 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.12 
 
 
851 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2384  fimbrial usher protein  29.41 
 
 
829 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0771751  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2295  fimbrial usher protein  29.41 
 
 
829 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  27.3 
 
 
863 aa  119  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.3 
 
 
877 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  28.38 
 
 
842 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.81 
 
 
840 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  28.12 
 
 
842 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.38 
 
 
832 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  27.14 
 
 
839 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  28.12 
 
 
842 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.33 
 
 
866 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  26.82 
 
 
839 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.06 
 
 
833 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  26.75 
 
 
809 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.53 
 
 
828 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.2 
 
 
876 aa  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  26.61 
 
 
809 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.57 
 
 
831 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  25.65 
 
 
809 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  26.61 
 
 
809 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  25.65 
 
 
809 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0934  fimbrial usher protein  27.38 
 
 
826 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>