295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_11080 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  53.14 
 
 		 880 aa  867    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  100 
 
 		 844 aa  1690    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  79.57 
 
 		 842 aa  1345    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.93 
 
 		 866 aa  598  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.13 
 
 		 880 aa  581  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.17 
 
 		 1040 aa  575  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.87 
 
 		 886 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.02 
 
 		 901 aa  571  1e-161  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  39.95 
 
 		 901 aa  569  1e-161  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.3 
 
 		 850 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.36 
 
 		 867 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.39 
 
 		 872 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.1 
 
 		 866 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.31 
 
 		 963 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.79 
 
 		 856 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.57 
 
 		 852 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.32 
 
 		 861 aa  535  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  38.31 
 
 		 939 aa  522  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.88 
 
 		 930 aa  522  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  37.62 
 
 		 913 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.85 
 
 		 884 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  37.62 
 
 		 914 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  37.62 
 
 		 914 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.78 
 
 		 870 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  37.78 
 
 		 870 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.86 
 
 		 851 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  37.8 
 
 		 872 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  35.75 
 
 		 866 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.08 
 
 		 852 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  35.75 
 
 		 861 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.2 
 
 		 865 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  35.51 
 
 		 866 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  35.05 
 
 		 866 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  34.9 
 
 		 865 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  36.29 
 
 		 868 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  35.12 
 
 		 833 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.12 
 
 		 890 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3974  putative outer membrane usher protein  34.98 
 
 		 866 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.183336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  34.45 
 
 		 866 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  35.46 
 
 		 888 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.45 
 
 		 887 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  33.65 
 
 		 866 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.53 
 
 		 929 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  34.21 
 
 		 839 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.29 
 
 		 863 aa  415  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  32.29 
 
 		 854 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  32.29 
 
 		 854 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.71 
 
 		 819 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0323635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  32.93 
 
 		 839 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  32.41 
 
 		 875 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.49 
 
 		 883 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  32.48 
 
 		 863 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  32.49 
 
 		 883 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  32.84 
 
 		 878 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4155  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.9 
 
 		 836 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  32.84 
 
 		 878 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  32.52 
 
 		 856 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  32.54 
 
 		 866 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.54 
 
 		 866 aa  398  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  32.54 
 
 		 866 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.72 
 
 		 878 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.05 
 
 		 840 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  32.76 
 
 		 878 aa  399  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  32.18 
 
 		 866 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  32.3 
 
 		 866 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  32.3 
 
 		 866 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.27 
 
 		 871 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.25 
 
 		 851 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  34.22 
 
 		 850 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  34.22 
 
 		 833 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  33.49 
 
 		 870 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  33.33 
 
 		 870 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  33.62 
 
 		 833 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2388  fimbrial usher protein  32.08 
 
 		 828 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  32.3 
 
 		 866 aa  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  33.62 
 
 		 870 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  33.25 
 
 		 870 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  33.66 
 
 		 833 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2339  fimbrial usher protein  31.96 
 
 		 828 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.365526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2496  fimbrial usher protein  31.84 
 
 		 828 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.775864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  33.37 
 
 		 870 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.63 
 
 		 876 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  32.66 
 
 		 869 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.49 
 
 		 877 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  32.54 
 
 		 869 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  32.66 
 
 		 869 aa  382  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.54 
 
 		 869 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.9 
 
 		 828 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.81 
 
 		 837 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  32.54 
 
 		 869 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.93 
 
 		 850 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  32.71 
 
 		 842 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  34.77 
 
 		 853 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.73 
 
 		 832 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  35.07 
 
 		 853 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.59 
 
 		 837 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  32.51 
 
 		 842 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  34.81 
 
 		 853 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  34.95 
 
 		 853 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  32.51 
 
 		 842 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>