283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1817 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  43.91 
 
 		 901 aa  725    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.3 
 
 		 861 aa  719    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.79 
 
 		 901 aa  725    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 851 aa  1749    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.16 
 
 		 880 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.88 
 
 		 867 aa  582  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.5 
 
 		 866 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.02 
 
 		 850 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.51 
 
 		 886 aa  572  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.77 
 
 		 866 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.89 
 
 		 872 aa  555  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.6 
 
 		 852 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.58 
 
 		 930 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.48 
 
 		 870 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.23 
 
 		 856 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  35.48 
 
 		 870 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.33 
 
 		 1040 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  36.12 
 
 		 914 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  36.12 
 
 		 913 aa  522  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  35.48 
 
 		 939 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  36.12 
 
 		 914 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.15 
 
 		 852 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.63 
 
 		 884 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  34.63 
 
 		 868 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  36.3 
 
 		 842 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  34.86 
 
 		 844 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.18 
 
 		 963 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.61 
 
 		 819 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0323635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  34.14 
 
 		 872 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  35.16 
 
 		 866 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  35.2 
 
 		 861 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.49 
 
 		 865 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  34.92 
 
 		 866 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4155  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.7 
 
 		 836 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.29 
 
 		 883 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.49 
 
 		 887 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  32.41 
 
 		 883 aa  465  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  32.18 
 
 		 875 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  33.49 
 
 		 865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  32.66 
 
 		 837 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  34.09 
 
 		 854 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  33.72 
 
 		 866 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3092  fimbrial usher protein  32.96 
 
 		 826 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.09 
 
 		 863 aa  449  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  34.09 
 
 		 854 aa  449  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1548  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.25 
 
 		 826 aa  444  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1538  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.25 
 
 		 826 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  33.26 
 
 		 866 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.45 
 
 		 929 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.81 
 
 		 890 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  31.94 
 
 		 853 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.68 
 
 		 866 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.35 
 
 		 864 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2245  fimbrial usher protein  33.25 
 
 		 826 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.141315  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  31.94 
 
 		 853 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  34.31 
 
 		 888 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5161  fimbrial usher protein  34.19 
 
 		 844 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.54 
 
 		 850 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  33.03 
 
 		 866 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  32.68 
 
 		 866 aa  439  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.55 
 
 		 832 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  32.91 
 
 		 866 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2399  fimbrial usher protein  33.09 
 
 		 826 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  32.68 
 
 		 866 aa  439  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0934  fimbrial usher protein  33.33 
 
 		 826 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  31.94 
 
 		 853 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  32.06 
 
 		 853 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  33.01 
 
 		 870 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2388  fimbrial usher protein  33.33 
 
 		 828 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  32.11 
 
 		 863 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3974  putative outer membrane usher protein  35.04 
 
 		 866 aa  436  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.183336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2339  fimbrial usher protein  33.66 
 
 		 828 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.365526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  34.3 
 
 		 866 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2384  fimbrial usher protein  33.71 
 
 		 829 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0771751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.73 
 
 		 851 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  31.71 
 
 		 853 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  32.2 
 
 		 878 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  32.2 
 
 		 878 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.32 
 
 		 831 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2295  fimbrial usher protein  33.58 
 
 		 829 aa  432  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.92 
 
 		 837 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  33.29 
 
 		 839 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2496  fimbrial usher protein  33.5 
 
 		 828 aa  432  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.775864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  32.89 
 
 		 870 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  32.75 
 
 		 870 aa  432  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  33.01 
 
 		 870 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  31.5 
 
 		 833 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  31.91 
 
 		 878 aa  428  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.08 
 
 		 878 aa  428  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  32.68 
 
 		 866 aa  429  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  34.33 
 
 		 866 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.69 
 
 		 859 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  32.75 
 
 		 870 aa  429  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  31.4 
 
 		 856 aa  422  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.96 
 
 		 838 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.69 
 
 		 880 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  32.62 
 
 		 869 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  33.33 
 
 		 840 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.38 
 
 		 833 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  33.25 
 
 		 838 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>