293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0168 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_37030  usher  43.08 
 
 		 872 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 864 aa  1763    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  49.04 
 
 		 850 aa  781    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  40.93 
 
 		 868 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  39.24 
 
 		 883 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.24 
 
 		 883 aa  595  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.54 
 
 		 887 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  38.9 
 
 		 875 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  39.32 
 
 		 854 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.18 
 
 		 929 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  38.82 
 
 		 854 aa  568  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.8 
 
 		 863 aa  568  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  37.53 
 
 		 853 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  37.41 
 
 		 853 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  37.41 
 
 		 853 aa  512  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  37.3 
 
 		 853 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  37.41 
 
 		 853 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.84 
 
 		 1040 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37 
 
 		 866 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36 
 
 		 901 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  36 
 
 		 901 aa  482  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.61 
 
 		 861 aa  462  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.17 
 
 		 852 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.27 
 
 		 963 aa  455  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.45 
 
 		 872 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.35 
 
 		 851 aa  442  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.99 
 
 		 852 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  34.51 
 
 		 870 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.43 
 
 		 870 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.62 
 
 		 850 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.87 
 
 		 886 aa  429  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  32.17 
 
 		 914 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  32.05 
 
 		 913 aa  426  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.59 
 
 		 867 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  32.05 
 
 		 914 aa  426  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.12 
 
 		 884 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  31.47 
 
 		 939 aa  422  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.33 
 
 		 880 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.27 
 
 		 930 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.43 
 
 		 866 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.96 
 
 		 871 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.61 
 
 		 877 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.11 
 
 		 856 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  31.13 
 
 		 863 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  30.92 
 
 		 878 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  31.58 
 
 		 873 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  30.92 
 
 		 878 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.92 
 
 		 878 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  30.29 
 
 		 878 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.08 
 
 		 833 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  31.41 
 
 		 888 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0026  outer membrane usher protein FimD  31.7 
 
 		 888 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0792355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  31.7 
 
 		 888 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  30.72 
 
 		 844 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  32.02 
 
 		 833 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.17 
 
 		 837 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  31.7 
 
 		 888 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  32.01 
 
 		 842 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  31.94 
 
 		 850 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  32.01 
 
 		 842 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  31.94 
 
 		 833 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  31.02 
 
 		 856 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  32.01 
 
 		 842 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  31.94 
 
 		 833 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  31.58 
 
 		 851 aa  366  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.15 
 
 		 819 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0323635 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  32.6 
 
 		 866 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  31.85 
 
 		 866 aa  361  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  32.75 
 
 		 809 aa  361  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  31.98 
 
 		 866 aa  360  7e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  31.98 
 
 		 866 aa  360  7e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.89 
 
 		 866 aa  360  8e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  32.62 
 
 		 809 aa  360  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  32.5 
 
 		 809 aa  359  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  32.5 
 
 		 809 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  31.73 
 
 		 866 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  32.5 
 
 		 809 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  32.52 
 
 		 866 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  30.99 
 
 		 870 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  30.73 
 
 		 870 aa  356  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  30.75 
 
 		 870 aa  356  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  30.87 
 
 		 870 aa  356  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  30.77 
 
 		 869 aa  356  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  30.93 
 
 		 870 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.47 
 
 		 844 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  31.14 
 
 		 866 aa  355  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  31.14 
 
 		 861 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.51 
 
 		 865 aa  355  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.58 
 
 		 851 aa  354  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  31.4 
 
 		 842 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.38 
 
 		 840 aa  353  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.58 
 
 		 876 aa  352  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  31.53 
 
 		 839 aa  352  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  31.62 
 
 		 840 aa  352  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  31.1 
 
 		 866 aa  351  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  32.72 
 
 		 839 aa  351  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.1 
 
 		 880 aa  351  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.65 
 
 		 869 aa  351  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  30.65 
 
 		 869 aa  350  7e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  30.65 
 
 		 869 aa  350  7e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>