288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00138 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  100 
 
 		 866 aa  1783    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  100 
 
 		 861 aa  1771    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  97.69 
 
 		 865 aa  1745    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  99.65 
 
 		 866 aa  1776    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  59.51 
 
 		 866 aa  1094    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  61.06 
 
 		 866 aa  1081    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3974  putative outer membrane usher protein  60.42 
 
 		 866 aa  1058    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.183336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  83.72 
 
 		 866 aa  1509    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  47.09 
 
 		 865 aa  765    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  62.41 
 
 		 888 aa  1109    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  36.79 
 
 		 913 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  36.79 
 
 		 914 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  36.79 
 
 		 914 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  37.22 
 
 		 939 aa  535  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.64 
 
 		 930 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.37 
 
 		 866 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.76 
 
 		 886 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.71 
 
 		 884 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.28 
 
 		 850 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.42 
 
 		 880 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.38 
 
 		 856 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.07 
 
 		 901 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.84 
 
 		 963 aa  502  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.25 
 
 		 1040 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  35.71 
 
 		 901 aa  498  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.87 
 
 		 867 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.3 
 
 		 852 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.28 
 
 		 861 aa  482  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.16 
 
 		 851 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  36.69 
 
 		 842 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  35.75 
 
 		 844 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  36 
 
 		 870 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36 
 
 		 870 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.24 
 
 		 872 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.66 
 
 		 866 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.9 
 
 		 852 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.73 
 
 		 890 aa  426  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  33.73 
 
 		 833 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  32.09 
 
 		 878 aa  412  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.74 
 
 		 880 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2245  fimbrial usher protein  32.54 
 
 		 826 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.141315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  31.97 
 
 		 863 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  32.09 
 
 		 878 aa  412  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1538  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.54 
 
 		 826 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1548  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.54 
 
 		 826 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.98 
 
 		 878 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  32.23 
 
 		 856 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  32.17 
 
 		 878 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2384  fimbrial usher protein  32.32 
 
 		 829 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0771751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2295  fimbrial usher protein  32.44 
 
 		 829 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  33.06 
 
 		 839 aa  406  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2399  fimbrial usher protein  32.54 
 
 		 826 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0934  fimbrial usher protein  32.38 
 
 		 826 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  32.31 
 
 		 850 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  33.29 
 
 		 839 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  32.6 
 
 		 840 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  31.86 
 
 		 833 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3092  fimbrial usher protein  31.07 
 
 		 826 aa  395  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  31.2 
 
 		 833 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  31.86 
 
 		 833 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  33.21 
 
 		 809 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  33.21 
 
 		 809 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  33.21 
 
 		 809 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  33.21 
 
 		 809 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  33.41 
 
 		 839 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  31.7 
 
 		 869 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  31.7 
 
 		 869 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  33.21 
 
 		 809 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.46 
 
 		 867 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  32.13 
 
 		 870 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  32.24 
 
 		 870 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  32.32 
 
 		 870 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  32.24 
 
 		 870 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  32.05 
 
 		 870 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  31.12 
 
 		 869 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  31.47 
 
 		 869 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2339  fimbrial usher protein  31.36 
 
 		 828 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.365526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.47 
 
 		 869 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  32.06 
 
 		 866 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2388  fimbrial usher protein  31.53 
 
 		 828 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  31.83 
 
 		 871 aa  383  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  31.47 
 
 		 869 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  31.94 
 
 		 868 aa  383  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2496  fimbrial usher protein  31.36 
 
 		 828 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.775864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  32.01 
 
 		 866 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  31.94 
 
 		 866 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4155  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.94 
 
 		 836 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  32.87 
 
 		 838 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.94 
 
 		 866 aa  379  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  32.06 
 
 		 866 aa  378  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.79 
 
 		 838 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  32.44 
 
 		 872 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  32.75 
 
 		 838 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  32.75 
 
 		 838 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  31.94 
 
 		 866 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  32.79 
 
 		 863 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  32.87 
 
 		 838 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.06 
 
 		 844 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  30.31 
 
 		 854 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.37 
 
 		 819 aa  376  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0323635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>