297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1534 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  54.04 
 
 		 842 aa  870    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  53.14 
 
 		 844 aa  868    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 880 aa  1773    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.23 
 
 		 866 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.86 
 
 		 880 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.98 
 
 		 886 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.24 
 
 		 872 aa  538  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  39.81 
 
 		 913 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  39.72 
 
 		 939 aa  535  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.9 
 
 		 856 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  39.69 
 
 		 914 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  39.69 
 
 		 914 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  37.53 
 
 		 901 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.41 
 
 		 861 aa  528  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.25 
 
 		 867 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.65 
 
 		 901 aa  529  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.89 
 
 		 930 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.41 
 
 		 866 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.95 
 
 		 850 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.74 
 
 		 1040 aa  512  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.33 
 
 		 852 aa  512  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.71 
 
 		 852 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.52 
 
 		 884 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.58 
 
 		 963 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.84 
 
 		 887 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.79 
 
 		 870 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  33.79 
 
 		 870 aa  439  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  35.5 
 
 		 872 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  34.75 
 
 		 868 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.91 
 
 		 929 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.69 
 
 		 851 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  33.17 
 
 		 866 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  32.67 
 
 		 866 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  32.75 
 
 		 861 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  32.45 
 
 		 865 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.71 
 
 		 865 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.09 
 
 		 890 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  32.56 
 
 		 866 aa  405  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  33.09 
 
 		 833 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  32.72 
 
 		 866 aa  405  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  32.15 
 
 		 866 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  31.87 
 
 		 883 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  32.89 
 
 		 888 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.75 
 
 		 883 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.73 
 
 		 840 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.54 
 
 		 863 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  30.54 
 
 		 854 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  30.54 
 
 		 854 aa  392  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3974  putative outer membrane usher protein  33.1 
 
 		 866 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.183336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  31.4 
 
 		 875 aa  392  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  31.35 
 
 		 839 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  32.78 
 
 		 853 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  32.78 
 
 		 853 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  32.67 
 
 		 853 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  32.67 
 
 		 853 aa  383  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  33.22 
 
 		 850 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  33.22 
 
 		 833 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  33.1 
 
 		 833 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  32.55 
 
 		 853 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.67 
 
 		 875 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.67 
 
 		 875 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  32.98 
 
 		 833 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  31.74 
 
 		 839 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.41 
 
 		 871 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.96 
 
 		 853 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.51 
 
 		 837 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.66 
 
 		 852 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  31.85 
 
 		 842 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  31.66 
 
 		 842 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.02 
 
 		 876 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  30.75 
 
 		 863 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  31.85 
 
 		 842 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.66 
 
 		 878 aa  363  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  30.66 
 
 		 878 aa  363  9e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  30.66 
 
 		 878 aa  363  9e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  30.78 
 
 		 856 aa  363  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  30.78 
 
 		 878 aa  362  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.91 
 
 		 850 aa  361  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3292  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.89 
 
 		 835 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.32 
 
 		 877 aa  355  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.23 
 
 		 851 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.98 
 
 		 844 aa  353  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  29.96 
 
 		 869 aa  352  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  29.96 
 
 		 869 aa  351  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.15 
 
 		 867 aa  351  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  29.96 
 
 		 869 aa  351  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  29.96 
 
 		 869 aa  351  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.12 
 
 		 864 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  29.38 
 
 		 838 aa  350  9e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  29.38 
 
 		 838 aa  350  9e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.5 
 
 		 838 aa  350  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.84 
 
 		 869 aa  350  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  29.69 
 
 		 870 aa  349  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.38 
 
 		 838 aa  349  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  29.5 
 
 		 838 aa  349  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  29.5 
 
 		 863 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  29.69 
 
 		 870 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  29.39 
 
 		 838 aa  348  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  29.69 
 
 		 870 aa  348  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  29.69 
 
 		 870 aa  348  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>