299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1053 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  76.48 
 
 		 840 aa  1294    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  44.81 
 
 		 842 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  43.16 
 
 		 866 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  46.71 
 
 		 809 aa  760    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  42.5 
 
 		 878 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  55.24 
 
 		 851 aa  924    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.28 
 
 		 866 aa  663    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0026  outer membrane usher protein FimD  45.22 
 
 		 888 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0792355  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.5 
 
 		 878 aa  654    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  45 
 
 		 876 aa  705    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  42.61 
 
 		 863 aa  654    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  43.33 
 
 		 836 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  43.4 
 
 		 866 aa  660    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  42.38 
 
 		 878 aa  653    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  44.81 
 
 		 842 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  45.1 
 
 		 888 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  42.28 
 
 		 870 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  46.59 
 
 		 809 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 837 aa  1685    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  43.16 
 
 		 866 aa  659    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  46.46 
 
 		 848 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  45.1 
 
 		 888 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  46.71 
 
 		 809 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  42.69 
 
 		 856 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  43.57 
 
 		 836 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  46.33 
 
 		 848 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  42.5 
 
 		 878 aa  653    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  42.17 
 
 		 870 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  43.45 
 
 		 836 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.08 
 
 		 859 aa  661    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  43.28 
 
 		 866 aa  655    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  43.57 
 
 		 836 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0207  outer membrane usher protein FimD  46.45 
 
 		 848 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  45.1 
 
 		 873 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  46.71 
 
 		 809 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  46.45 
 
 		 848 aa  747    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  42.17 
 
 		 870 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  45.1 
 
 		 888 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  44.5 
 
 		 842 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  46.71 
 
 		 809 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  43.28 
 
 		 866 aa  659    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  46.33 
 
 		 848 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.62 
 
 		 833 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.43 
 
 		 877 aa  679    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  43.16 
 
 		 866 aa  656    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  42.05 
 
 		 870 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  42.05 
 
 		 870 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  40.56 
 
 		 869 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  40.56 
 
 		 869 aa  629  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  40.56 
 
 		 869 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  40.67 
 
 		 869 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.65 
 
 		 867 aa  627  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.56 
 
 		 869 aa  628  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  40.21 
 
 		 869 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  41.36 
 
 		 871 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  40.21 
 
 		 839 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  39.74 
 
 		 840 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.57 
 
 		 838 aa  591  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  40.57 
 
 		 863 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  40.33 
 
 		 838 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  40.33 
 
 		 838 aa  587  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  40.33 
 
 		 838 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.33 
 
 		 838 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5161  fimbrial usher protein  38.53 
 
 		 844 aa  585  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  40.33 
 
 		 838 aa  585  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2757  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.24 
 
 		 823 aa  568  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2118  fimbrial usher family protein  43.01 
 
 		 740 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.167309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.99 
 
 		 851 aa  565  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1531  outer membrane usher protein PsaC precursor  39.36 
 
 		 823 aa  560  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00459102  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2676  fimbrial usher protein  39.36 
 
 		 823 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.529958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  36.53 
 
 		 850 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.65 
 
 		 871 aa  487  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  36.29 
 
 		 833 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.87 
 
 		 866 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  36.29 
 
 		 833 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4882  outer membrane fimbrial usher protein  35.49 
 
 		 814 aa  479  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405826 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  36.29 
 
 		 833 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.26 
 
 		 861 aa  475  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.82 
 
 		 875 aa  475  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.82 
 
 		 875 aa  475  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.65 
 
 		 1040 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  37.52 
 
 		 839 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  36.06 
 
 		 901 aa  469  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.94 
 
 		 963 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  36.86 
 
 		 839 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.05 
 
 		 884 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.71 
 
 		 901 aa  462  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.04 
 
 		 851 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.27 
 
 		 828 aa  452  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.68 
 
 		 852 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3292  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.33 
 
 		 835 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249983 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.31 
 
 		 837 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.58 
 
 		 853 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  34.87 
 
 		 837 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.27 
 
 		 844 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.61 
 
 		 886 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.72 
 
 		 852 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  35.87 
 
 		 870 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.43 
 
 		 880 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.4 
 
 		 832 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>