294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0369 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  100 
 
 		 853 aa  1761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  99.06 
 
 		 853 aa  1746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  99.53 
 
 		 853 aa  1752    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  41.28 
 
 		 875 aa  645    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  41.98 
 
 		 883 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  99.3 
 
 		 853 aa  1749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.98 
 
 		 883 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  99.65 
 
 		 853 aa  1754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  43.12 
 
 		 868 aa  635  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  43.19 
 
 		 872 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.87 
 
 		 887 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.55 
 
 		 929 aa  552  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  39.26 
 
 		 854 aa  547  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  39.26 
 
 		 854 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.26 
 
 		 863 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  37.65 
 
 		 901 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.53 
 
 		 901 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.46 
 
 		 864 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.11 
 
 		 850 aa  515  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.72 
 
 		 861 aa  494  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.57 
 
 		 866 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.05 
 
 		 930 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.8 
 
 		 856 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.12 
 
 		 872 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.94 
 
 		 851 aa  445  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.85 
 
 		 880 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  33.68 
 
 		 939 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.86 
 
 		 886 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.71 
 
 		 1040 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  34.07 
 
 		 913 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.89 
 
 		 867 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  34.07 
 
 		 914 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  34.07 
 
 		 914 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.73 
 
 		 866 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.68 
 
 		 852 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.3 
 
 		 850 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.02 
 
 		 963 aa  416  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.91 
 
 		 871 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.2 
 
 		 870 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  32.2 
 
 		 870 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.75 
 
 		 884 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.53 
 
 		 840 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.59 
 
 		 852 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.98 
 
 		 851 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  31.66 
 
 		 878 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.66 
 
 		 878 aa  391  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.31 
 
 		 880 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  31.66 
 
 		 878 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.8 
 
 		 837 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  31.66 
 
 		 878 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  31.54 
 
 		 863 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.81 
 
 		 819 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0323635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  35.03 
 
 		 844 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  31.47 
 
 		 856 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.91 
 
 		 828 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.44 
 
 		 844 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  32.41 
 
 		 870 aa  365  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  31.81 
 
 		 870 aa  364  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  31.92 
 
 		 870 aa  364  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  31.76 
 
 		 870 aa  363  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  31.64 
 
 		 870 aa  362  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  35.37 
 
 		 842 aa  362  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  31.29 
 
 		 869 aa  360  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  32.3 
 
 		 839 aa  360  7e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  32.44 
 
 		 838 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  32.33 
 
 		 863 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.75 
 
 		 877 aa  358  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  31.19 
 
 		 851 aa  358  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  32.33 
 
 		 838 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  32.33 
 
 		 838 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.13 
 
 		 838 aa  357  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  31.29 
 
 		 869 aa  357  5.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  32.13 
 
 		 838 aa  356  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  31.17 
 
 		 869 aa  355  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  31.17 
 
 		 869 aa  355  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  31.17 
 
 		 869 aa  355  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.17 
 
 		 869 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  30.8 
 
 		 871 aa  354  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  31.18 
 
 		 833 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4155  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.91 
 
 		 836 aa  353  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.47 
 
 		 867 aa  353  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.23 
 
 		 875 aa  353  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.23 
 
 		 875 aa  353  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.85 
 
 		 876 aa  353  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  32.19 
 
 		 809 aa  353  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  32.19 
 
 		 809 aa  353  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.98 
 
 		 838 aa  352  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  32.07 
 
 		 809 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.94 
 
 		 859 aa  352  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  31.45 
 
 		 833 aa  352  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  32.19 
 
 		 809 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  31.37 
 
 		 833 aa  351  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  32.07 
 
 		 809 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  31.82 
 
 		 839 aa  350  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  32.12 
 
 		 865 aa  349  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  31.65 
 
 		 850 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  30.18 
 
 		 833 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2384  fimbrial usher protein  30.27 
 
 		 829 aa  348  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0771751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.18 
 
 		 890 aa  348  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2295  fimbrial usher protein  30.15 
 
 		 829 aa  347  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>