184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_33200 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_33200  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2960  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  79.37 
 
 		 223 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208736  normal  0.0259556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4185  hypothetical protein  80.72 
 
 		 223 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1244  DNA-glycosylase  76.68 
 
 		 223 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48860  hypothetical protein  79.82 
 
 		 223 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00328607  hitchhiker  0.0000000197287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1204  DNA-glycosylase  75.34 
 
 		 223 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1642  hypothetical protein  75.34 
 
 		 223 aa  362  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4075  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  75.34 
 
 		 223 aa  361  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4231  hypothetical protein  72.77 
 
 		 224 aa  344  8e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359508  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3704  hypothetical protein  69.51 
 
 		 223 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1685  hypothetical protein  69.06 
 
 		 223 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1166  hypothetical protein  53.11 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159746  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3551  3-methyladenine DNA glycosylase  48.15 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02522  3-methyl-adenine DNA glycosylase  42.79 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003561  hypothetical protein  41.86 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3932  3-methyladenine DNA glycosylase  46.67 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3839  3-methyladenine DNA glycosylase  46.67 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4389  3-methyladenine DNA glycosylase  45.24 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0127  3-methyladenine DNA glycosylase  45.24 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4214  methyladenine glycosylase  44.76 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4062  3-methyladenine DNA glycosylase  44.02 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4048  3-methyladenine DNA glycosylase  44.76 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4253  3-methyladenine DNA glycosylase  44.29 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0280  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  42.4 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.579527  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0029  3-methyladenine DNA glycosylase  39.37 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4696  3-methyladenine DNA glycosylase  43.27 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3866  3-methyladenine DNA glycosylase  40.87 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4987  hypothetical protein  39.38 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03491  3-methyl-adenine DNA glycosylase  40.09 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0212  putative DNA glycosylase protein  40.62 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2049  hypothetical protein  43.65 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.443421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2831  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.71 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.899123  normal  0.113104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4208  hypothetical protein  38.53 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0150  3-methyladenine DNA glycosylase  42.93 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0129  3-methyladenine DNA glycosylase  41.58 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.11 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.51 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.9 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.22 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.28 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0983  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  36.77 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.72 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.22 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0467  yggt family protein  38.89 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.58 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.57 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0235  methyladenine glycosylase  29.05 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.31 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  32.58 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0312  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.15 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.547447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.71 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.19 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1573  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.84 
 
 		 177 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.1 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.41 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.71 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  27.06 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2095  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.67 
 
 		 183 aa  52  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.08 
 
 		 187 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0477  3-methyladenine DNA glycosylase  29.35 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0571733  normal  0.984687 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1722  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.76 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1756  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.76 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.792087  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0272  50S ribosomal protein L24 (BL23; 12 kDa DNA-binding protein; HPB12)  31.91 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.74 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  26.17 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.18 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0664  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.56 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.18 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23730  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.16 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00337474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.68 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.78 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.24 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.96 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0730  3-methyladenine DNA glycosylase  26.11 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.21 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.15 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.04 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.21 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1277  DNA-3-methyladenine glycosidase I  29.36 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.1 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.17 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  26.14 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.93 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.67 
 
 		 243 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.15 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.27 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.33 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  31.11 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.26 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.53 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.33 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.71 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.41 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.65 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.09 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>