187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0129 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0129  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 		 237 aa  494  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0150  3-methyladenine DNA glycosylase  86.03 
 
 		 229 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4389  3-methyladenine DNA glycosylase  75.11 
 
 		 229 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4062  3-methyladenine DNA glycosylase  76.42 
 
 		 229 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0127  3-methyladenine DNA glycosylase  75.11 
 
 		 229 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4214  methyladenine glycosylase  75.11 
 
 		 229 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4253  3-methyladenine DNA glycosylase  74.67 
 
 		 229 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4696  3-methyladenine DNA glycosylase  74.67 
 
 		 229 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3932  3-methyladenine DNA glycosylase  74.24 
 
 		 229 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4048  3-methyladenine DNA glycosylase  74.67 
 
 		 229 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3839  3-methyladenine DNA glycosylase  73.36 
 
 		 229 aa  363  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0029  3-methyladenine DNA glycosylase  72.05 
 
 		 229 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3551  3-methyladenine DNA glycosylase  66.96 
 
 		 228 aa  332  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3866  3-methyladenine DNA glycosylase  67.26 
 
 		 228 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4208  hypothetical protein  51.98 
 
 		 235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03491  3-methyl-adenine DNA glycosylase  48.67 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02522  3-methyl-adenine DNA glycosylase  50.88 
 
 		 228 aa  244  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003561  hypothetical protein  50 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2831  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.4 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.899123  normal  0.113104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4987  hypothetical protein  46.19 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0280  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  39.82 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.579527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48860  hypothetical protein  38.91 
 
 		 223 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00328607  hitchhiker  0.0000000197287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1642  hypothetical protein  37.1 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4075  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  37.1 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4185  hypothetical protein  38.01 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1244  DNA-glycosylase  36.65 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1204  DNA-glycosylase  36.2 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2960  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  37.1 
 
 		 223 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208736  normal  0.0259556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33200  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  38.01 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3704  hypothetical protein  39.71 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1166  hypothetical protein  36.82 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159746  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1685  hypothetical protein  39.23 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4231  hypothetical protein  36.77 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359508  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2049  hypothetical protein  36 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.443421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0212  putative DNA glycosylase protein  36.49 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.38 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.83 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  28.47 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.77 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.77 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.06 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.2 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0730  3-methyladenine DNA glycosylase  26.06 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.43 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.72 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.72 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1573  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.72 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.66 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1033  putative DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.86 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.374811  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  29.6 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.08 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.6 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  27.27 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  29.6 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  29.6 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  29.6 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  29.6 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  29.6 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.74 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  29.37 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.15 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.97 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.66 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1094  methyladenine glycosylase  30.14 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.66 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.66 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.66 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.66 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1722  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.77 
 
 		 186 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1756  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.77 
 
 		 186 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.792087  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.59 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.16 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  26.21 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.9 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  25.52 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.84 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.72 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.5 
 
 		 201 aa  52  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.97 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.94 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.97 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  29.23 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.4 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.59 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1229  DNA-3-methyladenine glycosylase I, putative  23.33 
 
 		 186 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.164878  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.54 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.09 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.97 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.03 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0241  DNA-3-methyladenine glycosylase I  23.81 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.97 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  27.59 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  29.23 
 
 		 190 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0235  methyladenine glycosylase  30.95 
 
 		 183 aa  49.3  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.37 
 
 		 188 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.37 
 
 		 188 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.7 
 
 		 187 aa  48.9  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.69 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.25 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.53 
 
 		 190 aa  48.5  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>