74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0212 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0212  putative DNA glycosylase protein  100 
 
 
229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0280  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  46.19 
 
 
222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.579527  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2049  hypothetical protein  49.34 
 
 
222 aa  191  9e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.443421 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03491  3-methyl-adenine DNA glycosylase  43.64 
 
 
233 aa  177  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3551  3-methyladenine DNA glycosylase  42.53 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4062  3-methyladenine DNA glycosylase  40.91 
 
 
229 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195158  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02522  3-methyl-adenine DNA glycosylase  42.47 
 
 
228 aa  170  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1166  hypothetical protein  43.56 
 
 
226 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159746  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1642  hypothetical protein  39.73 
 
 
223 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2960  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  40.18 
 
 
223 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208736  normal  0.0259556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33200  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  40.62 
 
 
223 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4075  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  39.73 
 
 
223 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1244  DNA-glycosylase  39.29 
 
 
223 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191176 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003561  hypothetical protein  42.47 
 
 
228 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3932  3-methyladenine DNA glycosylase  40.27 
 
 
229 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0127  3-methyladenine DNA glycosylase  40.91 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4389  3-methyladenine DNA glycosylase  40.91 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3866  3-methyladenine DNA glycosylase  38.18 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3839  3-methyladenine DNA glycosylase  40.27 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1204  DNA-glycosylase  38.39 
 
 
223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4214  methyladenine glycosylase  40.45 
 
 
229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4185  hypothetical protein  41.04 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48860  hypothetical protein  41.04 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00328607  hitchhiker  0.0000000197287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4048  3-methyladenine DNA glycosylase  39.37 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4253  3-methyladenine DNA glycosylase  40.45 
 
 
229 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2831  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.37 
 
 
224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.899123  normal  0.113104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4696  3-methyladenine DNA glycosylase  37.56 
 
 
229 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3704  hypothetical protein  35.27 
 
 
223 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0150  3-methyladenine DNA glycosylase  37.56 
 
 
229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4231  hypothetical protein  37.33 
 
 
224 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359508  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1685  hypothetical protein  35.27 
 
 
223 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0029  3-methyladenine DNA glycosylase  36.65 
 
 
229 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176771  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4987  hypothetical protein  36.96 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4208  hypothetical protein  37.27 
 
 
235 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0129  3-methyladenine DNA glycosylase  35.59 
 
 
237 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310966  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1441  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  27.34 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1573  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.5 
 
 
177 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  32.37 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.5 
 
 
197 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.32 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.66 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.15 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0983  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  30.72 
 
 
192 aa  46.2  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  32.76 
 
 
202 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  32.76 
 
 
202 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0235  methyladenine glycosylase  25 
 
 
183 aa  46.2  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23730  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.02 
 
 
183 aa  46.2  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00337474  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.76 
 
 
202 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  34.95 
 
 
215 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  38.67 
 
 
202 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.32 
 
 
191 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  38.67 
 
 
202 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  38.67 
 
 
202 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  38.67 
 
 
202 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.45 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.1 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3455  methyladenine glycosylase  25.9 
 
 
183 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0251027 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.2 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0938  methyladenine glycosylase  30.95 
 
 
180 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.245904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  32.43 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  31.9 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  32.43 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.61 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.71 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.73 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  33.71 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01997  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.86 
 
 
190 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.33 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1094  methyladenine glycosylase  24.84 
 
 
186 aa  42.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.85 
 
 
215 aa  42  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.38 
 
 
201 aa  41.6  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>