135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4696 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4696  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 		 229 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4048  3-methyladenine DNA glycosylase  95.2 
 
 		 229 aa  453  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3932  3-methyladenine DNA glycosylase  94.76 
 
 		 229 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3839  3-methyladenine DNA glycosylase  93.89 
 
 		 229 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0127  3-methyladenine DNA glycosylase  88.65 
 
 		 229 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4214  methyladenine glycosylase  88.65 
 
 		 229 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4389  3-methyladenine DNA glycosylase  88.65 
 
 		 229 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4253  3-methyladenine DNA glycosylase  88.21 
 
 		 229 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0150  3-methyladenine DNA glycosylase  74.24 
 
 		 229 aa  349  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0129  3-methyladenine DNA glycosylase  74.67 
 
 		 237 aa  348  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4062  3-methyladenine DNA glycosylase  69.43 
 
 		 229 aa  344  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0029  3-methyladenine DNA glycosylase  69.43 
 
 		 229 aa  344  7e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3866  3-methyladenine DNA glycosylase  67.26 
 
 		 228 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3551  3-methyladenine DNA glycosylase  66.96 
 
 		 228 aa  323  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03491  3-methyl-adenine DNA glycosylase  50.44 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4208  hypothetical protein  51.1 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02522  3-methyl-adenine DNA glycosylase  52.21 
 
 		 228 aa  244  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003561  hypothetical protein  50.44 
 
 		 228 aa  238  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4987  hypothetical protein  48.31 
 
 		 243 aa  233  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2831  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.2 
 
 		 224 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.899123  normal  0.113104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2960  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  46.89 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208736  normal  0.0259556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4185  hypothetical protein  43.69 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48860  hypothetical protein  42.08 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00328607  hitchhiker  0.0000000197287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4075  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  41.44 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1642  hypothetical protein  41.44 
 
 		 223 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1244  DNA-glycosylase  41.44 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1204  DNA-glycosylase  40.99 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0280  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  37.56 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.579527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4231  hypothetical protein  44.29 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359508  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1166  hypothetical protein  38.74 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159746  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33200  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  43.27 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3704  hypothetical protein  42.58 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1685  hypothetical protein  40.95 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0212  putative DNA glycosylase protein  37.56 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2049  hypothetical protein  36.04 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.443421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.13 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.47 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.32 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  27.97 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.33 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.03 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.97 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1297  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.77 
 
 		 179 aa  52.8  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.07 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.07 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.72 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.37 
 
 		 190 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.72 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.67 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.67 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.67 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.28 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  28.06 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.06 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  24.83 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  28.06 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  32.89 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.48 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.48 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3455  methyladenine glycosylase  26.98 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0251027 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  32.89 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  32.89 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  32.89 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.24 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1722  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.57 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1756  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.57 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.792087  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.66 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.52 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.93 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.6 
 
 		 200 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.46 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.9 
 
 		 191 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.33 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0857  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.42 
 
 		 198 aa  48.9  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.671236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.33 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1573  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.5 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0312  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.52 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.547447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1229  DNA-3-methyladenine glycosylase I, putative  21.33 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.164878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.09 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.77 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.89 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  28.47 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  26 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.78 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.88 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.55 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  26.81 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1033  putative DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.41 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.374811  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.35 
 
 		 187 aa  45.4  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.7 
 
 		 190 aa  45.1  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.57 
 
 		 186 aa  45.1  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.14 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.59 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  28.08 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.95 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.03 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.59 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.61 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>