266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3455 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3455  methyladenine glycosylase  100 
 
 
183 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0251027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3910  methyladenine glycosylase  65.5 
 
 
181 aa  249  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0771426  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0938  methyladenine glycosylase  56.74 
 
 
180 aa  223  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.245904 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0684  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.93 
 
 
198 aa  218  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01997  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.06 
 
 
190 aa  214  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1573  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.1 
 
 
177 aa  184  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.21 
 
 
190 aa  134  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.75 
 
 
191 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  39.43 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.04 
 
 
196 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0678  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.64 
 
 
189 aa  125  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000050702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.02 
 
 
202 aa  124  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.57 
 
 
190 aa  124  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.33 
 
 
186 aa  124  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.64 
 
 
186 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1297  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.85 
 
 
179 aa  121  6e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0477  3-methyladenine DNA glycosylase  40.35 
 
 
196 aa  121  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0571733  normal  0.984687 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.21 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.18 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.18 
 
 
183 aa  119  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.36 
 
 
190 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.96 
 
 
198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.89 
 
 
199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.1 
 
 
203 aa  117  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.1 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.76 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.95 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  37.29 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.22 
 
 
191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.97 
 
 
194 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.26 
 
 
198 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2291  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.47 
 
 
186 aa  115  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2095  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.41 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  38.1 
 
 
190 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.18 
 
 
187 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.63 
 
 
194 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  34.88 
 
 
202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0730  3-methyladenine DNA glycosylase  38.1 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  36.78 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.34 
 
 
220 aa  113  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.35 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.35 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.83 
 
 
198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.47 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2670  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.2 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0484172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.76 
 
 
235 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  35.47 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  35.47 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.23 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40 
 
 
187 aa  111  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.36 
 
 
198 aa  111  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.96 
 
 
198 aa  111  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.97 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.67 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  34.88 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.42 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  34.88 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.43 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  34.88 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  34.88 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.91 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.3 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.13 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.93 
 
 
217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.4 
 
 
221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.46 
 
 
210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.4 
 
 
214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.43 
 
 
193 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.64 
 
 
199 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.72 
 
 
200 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1933  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.08 
 
 
193 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.72 
 
 
200 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.72 
 
 
200 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.06 
 
 
186 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.72 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.71 
 
 
200 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0999  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.51 
 
 
195 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142815  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.72 
 
 
201 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.87 
 
 
208 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.71 
 
 
204 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.71 
 
 
198 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.96 
 
 
196 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.53 
 
 
189 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.57 
 
 
192 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.72 
 
 
201 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0312  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.16 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.547447  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0235  methyladenine glycosylase  36.81 
 
 
183 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.06 
 
 
225 aa  107  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.87 
 
 
199 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.94 
 
 
194 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.78 
 
 
204 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.06 
 
 
208 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.72 
 
 
200 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.16 
 
 
208 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.15 
 
 
200 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.43 
 
 
212 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.84 
 
 
185 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23730  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.73 
 
 
183 aa  106  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00337474  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0027  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.48 
 
 
189 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.62 
 
 
213 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.724787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>