246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0999 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0999  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
195 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142815  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  69.02 
 
 
197 aa  249  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.67 
 
 
196 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.04 
 
 
198 aa  221  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.28 
 
 
194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.93 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.9 
 
 
191 aa  216  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.8 
 
 
208 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.84 
 
 
263 aa  210  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.37 
 
 
189 aa  207  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.22 
 
 
193 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.38 
 
 
192 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.32 
 
 
199 aa  202  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.92 
 
 
187 aa  202  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.4 
 
 
202 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.37 
 
 
194 aa  197  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.32 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.32 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.37 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8424  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.83 
 
 
185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.719422  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.8 
 
 
211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.28 
 
 
201 aa  194  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.68 
 
 
227 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.97 
 
 
203 aa  191  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.38 
 
 
186 aa  191  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.24 
 
 
191 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  47.57 
 
 
189 aa  190  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  54.64 
 
 
189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.56 
 
 
203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55 
 
 
192 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.91 
 
 
225 aa  188  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.31 
 
 
203 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.69 
 
 
221 aa  187  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.76 
 
 
193 aa  185  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
194 aa  184  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.69 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.17 
 
 
196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.65 
 
 
202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.85 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.54 
 
 
202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.72 
 
 
198 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.69 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.69 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.4 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.51 
 
 
186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.28 
 
 
187 aa  181  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4003  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.32 
 
 
209 aa  181  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4077  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.32 
 
 
209 aa  181  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0485352  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.46 
 
 
208 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.12 
 
 
193 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.28 
 
 
187 aa  180  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 
209 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.12 
 
 
193 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  50.28 
 
 
187 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 
185 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  50.28 
 
 
187 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.28 
 
 
187 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.52 
 
 
192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0477  3-methyladenine DNA glycosylase  43.43 
 
 
196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0571733  normal  0.984687 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.57 
 
 
218 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.45 
 
 
212 aa  178  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.02 
 
 
187 aa  178  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.25 
 
 
212 aa  178  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.55 
 
 
195 aa  178  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.49 
 
 
232 aa  177  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.02 
 
 
192 aa  177  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  177  9e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  177  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  177  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.07 
 
 
210 aa  177  9e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  176  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.69 
 
 
187 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.15 
 
 
200 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.77 
 
 
200 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.02 
 
 
189 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.89 
 
 
198 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.59 
 
 
191 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.63 
 
 
186 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.33 
 
 
196 aa  176  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.12 
 
 
208 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.2 
 
 
190 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.77 
 
 
200 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.12 
 
 
193 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.89 
 
 
190 aa  175  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.53 
 
 
196 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.46 
 
 
187 aa  175  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
241 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.67 
 
 
224 aa  175  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.24 
 
 
200 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.82 
 
 
207 aa  175  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
209 aa  175  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.48 
 
 
199 aa  174  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 
223 aa  174  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
209 aa  174  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.1 
 
 
209 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.67 
 
 
195 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  49.21 
 
 
215 aa  174  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11234  DNA-3-methyladenine glycosylase I tagA  54.24 
 
 
204 aa  174  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127053  normal  0.0780895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>