241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2374 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 		 208 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  80.88 
 
 		 208 aa  355  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  78.37 
 
 		 208 aa  353  7.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  80.1 
 
 		 217 aa  342  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  80.2 
 
 		 208 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  78.43 
 
 		 218 aa  339  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  78.11 
 
 		 217 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.43 
 
 		 198 aa  275  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.06 
 
 		 207 aa  273  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.41 
 
 		 198 aa  272  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63 
 
 		 209 aa  268  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.5 
 
 		 209 aa  266  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.16 
 
 		 213 aa  261  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.58 
 
 		 221 aa  257  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.78 
 
 		 223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6706  methyladenine glycosylase  66.15 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535788  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6187  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.45 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.98 
 
 		 195 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.45 
 
 		 194 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.85 
 
 		 214 aa  236  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.37 
 
 		 215 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.37 
 
 		 195 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.24 
 
 		 192 aa  234  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.29 
 
 		 191 aa  230  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.55 
 
 		 196 aa  229  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.84 
 
 		 194 aa  229  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  61.11 
 
 		 189 aa  229  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.83 
 
 		 196 aa  226  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.11 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.22 
 
 		 193 aa  226  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  59.55 
 
 		 189 aa  223  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.46 
 
 		 192 aa  223  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.55 
 
 		 195 aa  222  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  56.67 
 
 		 190 aa  222  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.75 
 
 		 192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.22 
 
 		 202 aa  221  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.74 
 
 		 199 aa  221  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.83 
 
 		 191 aa  221  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.68 
 
 		 198 aa  221  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.26 
 
 		 190 aa  220  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.85 
 
 		 191 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.22 
 
 		 186 aa  220  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.88 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55 
 
 		 188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55 
 
 		 188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.61 
 
 		 196 aa  218  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.25 
 
 		 187 aa  218  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.95 
 
 		 187 aa  218  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.65 
 
 		 190 aa  217  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.45 
 
 		 193 aa  217  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.65 
 
 		 190 aa  216  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.45 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.59 
 
 		 190 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.01 
 
 		 191 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.05 
 
 		 198 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.45 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.45 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.45 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.75 
 
 		 194 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.48 
 
 		 191 aa  215  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.93 
 
 		 212 aa  215  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.65 
 
 		 190 aa  215  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 		 204 aa  214  5e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.01 
 
 		 189 aa  214  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.48 
 
 		 191 aa  214  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.11 
 
 		 187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00010  constitutive 3-methyl-adenine DNA glycosylase I  54.55 
 
 		 202 aa  212  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0857  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.09 
 
 		 198 aa  211  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.671236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.1 
 
 		 193 aa  211  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.45 
 
 		 187 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.55 
 
 		 183 aa  211  9e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.94 
 
 		 191 aa  210  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.89 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.72 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  48.9 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  48.9 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.79 
 
 		 202 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0027  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.97 
 
 		 189 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.3 
 
 		 200 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.9 
 
 		 187 aa  208  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.91 
 
 		 186 aa  208  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.01 
 
 		 200 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.9 
 
 		 187 aa  208  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.08 
 
 		 200 aa  207  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.9 
 
 		 187 aa  207  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.9 
 
 		 187 aa  207  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.9 
 
 		 187 aa  207  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.9 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.49 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.09 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.46 
 
 		 198 aa  206  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.79 
 
 		 198 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.04 
 
 		 204 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.25 
 
 		 185 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.65 
 
 		 186 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.81 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.09 
 
 		 187 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0678  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.8 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000050702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.51 
 
 		 200 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.04 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.899334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>