266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1573 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1573  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
177 aa  362  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0938  methyladenine glycosylase  67.84 
 
 
180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.245904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01997  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.9 
 
 
190 aa  230  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0684  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.46 
 
 
198 aa  222  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3455  methyladenine glycosylase  52.1 
 
 
183 aa  184  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0251027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3910  methyladenine glycosylase  52.66 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0771426  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.25 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0730  3-methyladenine DNA glycosylase  38.73 
 
 
184 aa  123  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.43 
 
 
213 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.35 
 
 
192 aa  122  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.52 
 
 
221 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.46 
 
 
196 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.68 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.14 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40 
 
 
209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0999  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.77 
 
 
195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142815  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.56 
 
 
185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  36.72 
 
 
189 aa  116  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.46 
 
 
209 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.85 
 
 
203 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0235  methyladenine glycosylase  35.36 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.48 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.7 
 
 
197 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.61 
 
 
218 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.63 
 
 
195 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.2 
 
 
189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.78 
 
 
191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.02 
 
 
198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.43 
 
 
210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.87 
 
 
214 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.82 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.25 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.64 
 
 
202 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  38.64 
 
 
202 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  38.64 
 
 
202 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0857  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.35 
 
 
198 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.671236  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.83 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.2 
 
 
191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0241  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.11 
 
 
195 aa  111  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.64 
 
 
203 aa  111  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.85 
 
 
202 aa  111  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.43 
 
 
190 aa  111  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.48 
 
 
224 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  38.07 
 
 
202 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  38.07 
 
 
202 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.2 
 
 
208 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.06 
 
 
202 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  38.07 
 
 
202 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  38.07 
 
 
202 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.21 
 
 
193 aa  110  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  39.38 
 
 
215 aa  110  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  38.07 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.71 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.91 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.32 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  37.78 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.18 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.68 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.15 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.69 
 
 
218 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.71 
 
 
208 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.92 
 
 
193 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.99 
 
 
241 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.08 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0272  50S ribosomal protein L24 (BL23; 12 kDa DNA-binding protein; HPB12)  33.9 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.41 
 
 
188 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0983  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  33.33 
 
 
192 aa  108  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.41 
 
 
188 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.54 
 
 
191 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.2 
 
 
200 aa  107  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.55 
 
 
192 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.95 
 
 
203 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.93 
 
 
192 aa  107  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.29 
 
 
198 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.43 
 
 
243 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.2 
 
 
191 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  39.39 
 
 
247 aa  107  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl277  DNA-3-methyladenine glycosidase  32.77 
 
 
187 aa  106  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000678325  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.14 
 
 
194 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.87 
 
 
241 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.21 
 
 
217 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.36 
 
 
196 aa  107  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.05 
 
 
217 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.69 
 
 
208 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.52 
 
 
208 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.07 
 
 
197 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.14 
 
 
210 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.16 
 
 
209 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.35 
 
 
235 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.36 
 
 
195 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.71 
 
 
208 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.81 
 
 
194 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.36 
 
 
215 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.88 
 
 
217 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.27 
 
 
211 aa  105  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.72 
 
 
208 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  35.98 
 
 
189 aa  104  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.47 
 
 
198 aa  104  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.57 
 
 
223 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1297  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.74 
 
 
179 aa  104  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>