264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3540 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  73.11 
 
 
223 aa  315  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  72.64 
 
 
232 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.29 
 
 
214 aa  310  9e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  71.01 
 
 
235 aa  291  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.86 
 
 
208 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  62.8 
 
 
215 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.34 
 
 
241 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.37 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.49 
 
 
217 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.67 
 
 
241 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.31 
 
 
208 aa  270  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.98 
 
 
209 aa  269  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0399  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.83 
 
 
211 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.176376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.46 
 
 
209 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.85 
 
 
212 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  60.29 
 
 
218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.37 
 
 
215 aa  250  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.9 
 
 
199 aa  238  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.38 
 
 
206 aa  236  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.39 
 
 
197 aa  234  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57 
 
 
200 aa  229  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1033  putative DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.79 
 
 
200 aa  223  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.374811  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  62.57 
 
 
247 aa  214  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.26 
 
 
196 aa  214  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 
199 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.11 
 
 
191 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.48 
 
 
196 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.8 
 
 
225 aa  193  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.95 
 
 
186 aa  193  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.06 
 
 
202 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.03 
 
 
212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.77 
 
 
191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.45 
 
 
194 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.03 
 
 
204 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.11 
 
 
227 aa  188  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.34 
 
 
186 aa  188  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  48.09 
 
 
189 aa  187  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.2 
 
 
211 aa  187  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.75 
 
 
263 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.75 
 
 
198 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  49.72 
 
 
187 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
194 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.26 
 
 
198 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  49.72 
 
 
187 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.2 
 
 
194 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.87 
 
 
187 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.11 
 
 
202 aa  185  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.89 
 
 
208 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.22 
 
 
193 aa  185  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.33 
 
 
196 aa  184  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.17 
 
 
187 aa  184  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.41 
 
 
193 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.74 
 
 
203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.44 
 
 
193 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.44 
 
 
193 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.44 
 
 
193 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.51 
 
 
215 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
192 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.75 
 
 
195 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.65 
 
 
197 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
201 aa  181  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.89 
 
 
193 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.89 
 
 
193 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  49.73 
 
 
189 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.44 
 
 
202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.96 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.11 
 
 
187 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.38 
 
 
193 aa  178  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.51 
 
 
198 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.33 
 
 
190 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.11 
 
 
198 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.2 
 
 
208 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.49 
 
 
199 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.17 
 
 
201 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.28 
 
 
191 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1277  DNA-3-methyladenine glycosidase I  48.11 
 
 
193 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.49 
 
 
190 aa  174  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  44.09 
 
 
184 aa  174  8e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.62 
 
 
187 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.57 
 
 
191 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.04 
 
 
193 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.07 
 
 
189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0477  3-methyladenine DNA glycosylase  44.04 
 
 
196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0571733  normal  0.984687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.63 
 
 
185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.7 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.8 
 
 
223 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.03 
 
 
220 aa  172  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.67 
 
 
190 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.74 
 
 
208 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.67 
 
 
190 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.89 
 
 
190 aa  171  7.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.84 
 
 
203 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>