264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0730 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0730  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 
184 aa  387  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.51 
 
 
186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  49.73 
 
 
189 aa  197  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.91 
 
 
190 aa  195  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.74 
 
 
199 aa  192  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 
191 aa  191  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2291  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.18 
 
 
186 aa  190  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.54 
 
 
191 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.39 
 
 
210 aa  187  7e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.91 
 
 
196 aa  186  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.54 
 
 
191 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2670  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.56 
 
 
192 aa  184  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0484172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.63 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl277  DNA-3-methyladenine glycosidase  46.03 
 
 
187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000678325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.37 
 
 
194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.41 
 
 
207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.45 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  46.67 
 
 
190 aa  181  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.57 
 
 
190 aa  181  8.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
191 aa  179  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.2 
 
 
192 aa  178  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.17 
 
 
218 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
198 aa  177  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.91 
 
 
202 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.9 
 
 
187 aa  177  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.39 
 
 
217 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.26 
 
 
200 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.26 
 
 
200 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.75 
 
 
198 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0678  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.02 
 
 
189 aa  177  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000050702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.26 
 
 
200 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.93 
 
 
186 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.09 
 
 
187 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.32 
 
 
212 aa  175  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.26 
 
 
200 aa  175  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.32 
 
 
204 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.3 
 
 
200 aa  174  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  46.37 
 
 
190 aa  174  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.25 
 
 
194 aa  173  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.69 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.25 
 
 
198 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.74 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.41 
 
 
191 aa  173  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.69 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.3 
 
 
192 aa  173  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2095  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.38 
 
 
183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  46.37 
 
 
190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.33 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.22 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.96 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.41 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.51 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  46.41 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  46.41 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.9 
 
 
202 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.2 
 
 
201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.2 
 
 
201 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.67 
 
 
198 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  45.86 
 
 
202 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  45.86 
 
 
202 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  45.86 
 
 
202 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  45.86 
 
 
202 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0057  methyladenine glycosylase  44.86 
 
 
196 aa  169  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.51 
 
 
197 aa  167  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.3 
 
 
208 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.37 
 
 
214 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  44.75 
 
 
202 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.25 
 
 
221 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.44 
 
 
194 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.9 
 
 
200 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.99 
 
 
223 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.52 
 
 
198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.65 
 
 
183 aa  165  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.07 
 
 
185 aa  165  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.92 
 
 
194 aa  164  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.96 
 
 
208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  46.41 
 
 
189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.75 
 
 
235 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.7 
 
 
197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.82 
 
 
200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.3 
 
 
208 aa  164  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1033  putative DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.39 
 
 
200 aa  164  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.374811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.09 
 
 
199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1933  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.7 
 
 
193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  44.2 
 
 
193 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  44.2 
 
 
193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0312  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.32 
 
 
201 aa  161  4.0000000000000004e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.547447  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  44.2 
 
 
193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  44.2 
 
 
193 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0983  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  43.96 
 
 
192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0235  methyladenine glycosylase  42.62 
 
 
183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  44.2 
 
 
193 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0467  yggt family protein  42.78 
 
 
192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.2 
 
 
196 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.16 
 
 
241 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.39 
 
 
220 aa  160  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  42.54 
 
 
187 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  42.54 
 
 
187 aa  159  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.39 
 
 
208 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>