258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04565 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  100 
 
 
189 aa  400  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  70.33 
 
 
186 aa  277  8e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.64 
 
 
212 aa  251  6e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.64 
 
 
204 aa  250  8.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.92 
 
 
186 aa  249  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.61 
 
 
190 aa  244  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.15 
 
 
202 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.24 
 
 
191 aa  242  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.15 
 
 
194 aa  242  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.47 
 
 
191 aa  239  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.29 
 
 
196 aa  237  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.12 
 
 
187 aa  237  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2291  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.67 
 
 
186 aa  234  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.53 
 
 
190 aa  234  8e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.74 
 
 
191 aa  233  9e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.38 
 
 
198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.75 
 
 
193 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.52 
 
 
198 aa  229  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.38 
 
 
200 aa  228  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  58.7 
 
 
189 aa  227  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.3 
 
 
207 aa  227  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.37 
 
 
191 aa  226  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.55 
 
 
208 aa  223  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.89 
 
 
218 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.34 
 
 
192 aa  220  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.8 
 
 
197 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.87 
 
 
208 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.79 
 
 
196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.89 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.76 
 
 
217 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.69 
 
 
194 aa  218  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.76 
 
 
192 aa  217  8.999999999999998e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.43 
 
 
199 aa  216  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.72 
 
 
187 aa  216  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0057  methyladenine glycosylase  52.94 
 
 
196 aa  216  1e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.89 
 
 
186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0678  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.32 
 
 
189 aa  214  5e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000050702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.06 
 
 
208 aa  214  7e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.43 
 
 
210 aa  213  9.999999999999999e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.26 
 
 
194 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.06 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  53.33 
 
 
187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.19 
 
 
198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  53.33 
 
 
187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.69 
 
 
190 aa  212  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.33 
 
 
187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.01 
 
 
195 aa  211  5.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.25 
 
 
183 aa  211  7e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.05 
 
 
185 aa  210  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.19 
 
 
220 aa  209  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.78 
 
 
187 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.78 
 
 
187 aa  209  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.63 
 
 
190 aa  209  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  50.54 
 
 
190 aa  207  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.78 
 
 
187 aa  207  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.78 
 
 
187 aa  207  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.78 
 
 
187 aa  207  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.63 
 
 
190 aa  208  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.54 
 
 
188 aa  207  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.54 
 
 
188 aa  207  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.46 
 
 
198 aa  207  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.78 
 
 
187 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.63 
 
 
190 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
187 aa  206  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2670  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.68 
 
 
192 aa  206  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0484172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.65 
 
 
187 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.22 
 
 
191 aa  205  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.04 
 
 
192 aa  205  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.09 
 
 
187 aa  205  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 
187 aa  204  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.11 
 
 
200 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.17 
 
 
221 aa  203  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.54 
 
 
201 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.54 
 
 
201 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.46 
 
 
186 aa  202  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.15 
 
 
202 aa  202  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.81 
 
 
196 aa  201  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
194 aa  201  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 
198 aa  201  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.07 
 
 
198 aa  201  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.67 
 
 
202 aa  201  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.26 
 
 
195 aa  201  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.1 
 
 
212 aa  200  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  51.38 
 
 
190 aa  200  9e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  51.65 
 
 
190 aa  199  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.54 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0983  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  50.83 
 
 
192 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.94 
 
 
215 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  52.54 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  52.54 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.94 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
186 aa  199  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 
200 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1933  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.4 
 
 
193 aa  198  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.54 
 
 
214 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 
200 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 
200 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.25 
 
 
198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  51.98 
 
 
202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  51.98 
 
 
202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>