264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1922 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
200 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.73 
 
 
197 aa  271  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.18 
 
 
206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.33 
 
 
215 aa  255  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.8 
 
 
209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  58.33 
 
 
218 aa  252  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.5 
 
 
196 aa  251  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.1 
 
 
243 aa  248  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63 
 
 
199 aa  248  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.61 
 
 
241 aa  248  5e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.54 
 
 
241 aa  247  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.35 
 
 
209 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.52 
 
 
208 aa  240  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.43 
 
 
214 aa  239  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.61 
 
 
212 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.07 
 
 
208 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  66.1 
 
 
247 aa  234  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57 
 
 
224 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  54.41 
 
 
215 aa  228  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.84 
 
 
217 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0399  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.37 
 
 
211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.176376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.45 
 
 
232 aa  209  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.78 
 
 
235 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.45 
 
 
223 aa  208  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1033  putative DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.52 
 
 
200 aa  209  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.374811  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.21 
 
 
198 aa  203  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.87 
 
 
191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.56 
 
 
208 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.49 
 
 
187 aa  191  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  52.49 
 
 
187 aa  191  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  52.49 
 
 
187 aa  191  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.59 
 
 
187 aa  191  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.59 
 
 
187 aa  191  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.59 
 
 
187 aa  191  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.49 
 
 
187 aa  190  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.04 
 
 
187 aa  189  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.49 
 
 
193 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.49 
 
 
193 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.49 
 
 
193 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.49 
 
 
193 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.49 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.93 
 
 
187 aa  188  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.34 
 
 
201 aa  187  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.43 
 
 
208 aa  186  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.22 
 
 
199 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
190 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.35 
 
 
218 aa  184  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
190 aa  184  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.72 
 
 
190 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.28 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.65 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.69 
 
 
202 aa  182  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.13 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.09 
 
 
208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.63 
 
 
208 aa  181  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.74 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.53 
 
 
208 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.11 
 
 
186 aa  180  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.52 
 
 
263 aa  180  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47 
 
 
193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
192 aa  178  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8424  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.51 
 
 
185 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.719422  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.77 
 
 
212 aa  177  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.31 
 
 
187 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.27 
 
 
217 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.44 
 
 
198 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.39 
 
 
189 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.56 
 
 
212 aa  174  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  50.85 
 
 
189 aa  175  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.56 
 
 
204 aa  174  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.23 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.74 
 
 
217 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.42 
 
 
199 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.11 
 
 
211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.18 
 
 
187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.77 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.65 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.68 
 
 
225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  44.44 
 
 
189 aa  171  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.14 
 
 
192 aa  171  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07860  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.75 
 
 
249 aa  171  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.06 
 
 
203 aa  171  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.54 
 
 
198 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.15 
 
 
191 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.07 
 
 
187 aa  171  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.31 
 
 
193 aa  171  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.75 
 
 
191 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.46 
 
 
203 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
198 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.06 
 
 
202 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.46 
 
 
193 aa  169  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.67 
 
 
192 aa  169  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.19 
 
 
210 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.42 
 
 
215 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.81 
 
 
194 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.41 
 
 
187 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.42 
 
 
195 aa  167  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  44.21 
 
 
190 aa  167  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.37 
 
 
191 aa  166  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.96 
 
 
186 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>