260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01997 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01997  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
190 aa  396  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0938  methyladenine glycosylase  80 
 
 
180 aa  302  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.245904 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0684  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.17 
 
 
198 aa  238  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1573  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.9 
 
 
177 aa  230  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3910  methyladenine glycosylase  58.92 
 
 
181 aa  225  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0771426  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3455  methyladenine glycosylase  55.06 
 
 
183 aa  214  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0251027 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.18 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  41.18 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  40.64 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  40.11 
 
 
202 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  40.11 
 
 
202 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  40.11 
 
 
202 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  40.11 
 
 
202 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0730  3-methyladenine DNA glycosylase  40.23 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.33 
 
 
196 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  38.83 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.46 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.89 
 
 
191 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  35.87 
 
 
189 aa  122  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.38 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.15 
 
 
191 aa  118  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.22 
 
 
192 aa  118  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.65 
 
 
194 aa  117  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.36 
 
 
198 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.6 
 
 
193 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.43 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.54 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.43 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.5 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.5 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.43 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.5 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.88 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.61 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.74 
 
 
232 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0999  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.29 
 
 
195 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142815  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.74 
 
 
223 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.11 
 
 
198 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.13 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.44 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.87 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.11 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.67 
 
 
235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.73 
 
 
197 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.87 
 
 
212 aa  115  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0857  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.3 
 
 
198 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.671236  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.87 
 
 
204 aa  115  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.61 
 
 
217 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.7 
 
 
192 aa  114  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40 
 
 
202 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.96 
 
 
196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.7 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.35 
 
 
225 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.93 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07860  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.85 
 
 
249 aa  112  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.23 
 
 
196 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.97 
 
 
224 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.43 
 
 
197 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.94 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.18 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.45 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.58 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.48 
 
 
187 aa  111  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.85 
 
 
191 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.37 
 
 
194 aa  111  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.42 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  35.6 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.39 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.69 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2628  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.41 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.25 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.33 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.89 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.36 
 
 
198 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.46 
 
 
209 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.86 
 
 
218 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.49 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.94 
 
 
202 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.63 
 
 
191 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.77 
 
 
188 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.77 
 
 
188 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35 
 
 
186 aa  108  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.7 
 
 
209 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.16 
 
 
210 aa  108  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  37.57 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.39 
 
 
198 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.78 
 
 
194 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.52 
 
 
214 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.87 
 
 
196 aa  107  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.99 
 
 
185 aa  107  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.9 
 
 
200 aa  107  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.6 
 
 
223 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.63 
 
 
213 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.11 
 
 
197 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.85 
 
 
198 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.34 
 
 
210 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.29 
 
 
187 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.17 
 
 
192 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.16 
 
 
209 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>