263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04190 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
201 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  72.97 
 
 
227 aa  285  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  70.56 
 
 
203 aa  280  8.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  72.08 
 
 
225 aa  280  9e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.59 
 
 
211 aa  280  9e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.46 
 
 
202 aa  266  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.19 
 
 
201 aa  264  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07860  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.6 
 
 
249 aa  233  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.79 
 
 
198 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.55 
 
 
208 aa  208  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.36 
 
 
263 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0664  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.59 
 
 
197 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.83 
 
 
218 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.34 
 
 
193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.68 
 
 
193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.6 
 
 
221 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.24 
 
 
197 aa  193  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.44 
 
 
189 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.15 
 
 
203 aa  188  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.52 
 
 
187 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.59 
 
 
199 aa  184  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.41 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.69 
 
 
208 aa  182  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
213 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.23 
 
 
194 aa  178  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.37 
 
 
194 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.72 
 
 
210 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.46 
 
 
209 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.97 
 
 
209 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.63 
 
 
191 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.99 
 
 
198 aa  176  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.85 
 
 
196 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.17 
 
 
224 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.16 
 
 
192 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.07 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  48.07 
 
 
189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.6 
 
 
195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.25 
 
 
195 aa  171  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.94 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.49 
 
 
187 aa  171  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.33 
 
 
208 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  46.93 
 
 
187 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  46.93 
 
 
187 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  46.93 
 
 
187 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  46.93 
 
 
187 aa  168  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.39 
 
 
217 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  46.93 
 
 
187 aa  168  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  46.93 
 
 
187 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0999  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.08 
 
 
195 aa  167  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142815  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  46.93 
 
 
187 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  46.93 
 
 
187 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.41 
 
 
191 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.85 
 
 
196 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.08 
 
 
215 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.15 
 
 
223 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.15 
 
 
214 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.63 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.48 
 
 
243 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11234  DNA-3-methyladenine glycosylase I tagA  51.11 
 
 
204 aa  165  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127053  normal  0.0780895 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.78 
 
 
194 aa  165  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.37 
 
 
187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  46.11 
 
 
218 aa  164  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.66 
 
 
208 aa  164  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.05 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.05 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6187  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.13 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.6 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  45.56 
 
 
193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  46.37 
 
 
193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.45 
 
 
241 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  46.56 
 
 
190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.4 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.78 
 
 
202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.45 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.5 
 
 
186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.69 
 
 
217 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.43 
 
 
191 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.86 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.56 
 
 
193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.57 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4003  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.17 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  45 
 
 
193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4077  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.17 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0485352  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  45 
 
 
193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  45 
 
 
193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.81 
 
 
187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.02 
 
 
208 aa  161  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  44.44 
 
 
193 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.12 
 
 
191 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.95 
 
 
188 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.95 
 
 
188 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.56 
 
 
209 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.56 
 
 
209 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.22 
 
 
192 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.62 
 
 
185 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.3 
 
 
203 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.57 
 
 
235 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>