264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0457 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
209 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  92.82 
 
 
209 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  72.73 
 
 
215 aa  322  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0399  DNA-3-methyladenine glycosylase I  74.64 
 
 
211 aa  312  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.176376 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  69.71 
 
 
215 aa  308  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  69.23 
 
 
218 aa  308  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.27 
 
 
212 aa  296  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.22 
 
 
241 aa  279  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.25 
 
 
243 aa  274  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.77 
 
 
241 aa  274  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.67 
 
 
217 aa  270  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.46 
 
 
224 aa  261  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.81 
 
 
214 aa  256  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.54 
 
 
208 aa  249  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.11 
 
 
196 aa  249  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.35 
 
 
200 aa  244  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.88 
 
 
208 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1033  putative DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.12 
 
 
200 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.374811  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.69 
 
 
232 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.7 
 
 
199 aa  237  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.69 
 
 
223 aa  236  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.88 
 
 
235 aa  231  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.27 
 
 
197 aa  229  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.41 
 
 
206 aa  224  7e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.73 
 
 
191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  58.79 
 
 
247 aa  210  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.21 
 
 
198 aa  204  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.06 
 
 
199 aa  197  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.25 
 
 
210 aa  197  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.32 
 
 
263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.66 
 
 
193 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.23 
 
 
199 aa  192  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.6 
 
 
218 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  50.26 
 
 
189 aa  190  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.36 
 
 
208 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.73 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.73 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.73 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.22 
 
 
220 aa  188  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.19 
 
 
202 aa  188  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.38 
 
 
191 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.09 
 
 
187 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.82 
 
 
186 aa  187  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.89 
 
 
193 aa  187  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.19 
 
 
193 aa  187  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.19 
 
 
193 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  50.54 
 
 
187 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.09 
 
 
187 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  50.54 
 
 
187 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.83 
 
 
186 aa  186  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.54 
 
 
187 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 
187 aa  184  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.54 
 
 
187 aa  184  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.54 
 
 
187 aa  184  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.54 
 
 
187 aa  184  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.19 
 
 
185 aa  184  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.69 
 
 
196 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4003  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.74 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4077  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.74 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0485352  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.46 
 
 
191 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.87 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.43 
 
 
194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.34 
 
 
187 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.7 
 
 
196 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.19 
 
 
187 aa  181  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.56 
 
 
202 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.15 
 
 
190 aa  181  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.18 
 
 
208 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.22 
 
 
193 aa  180  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.43 
 
 
212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
195 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.57 
 
 
193 aa  178  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.34 
 
 
187 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.13 
 
 
208 aa  177  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.44 
 
 
191 aa  177  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.44 
 
 
208 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.87 
 
 
203 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.11 
 
 
198 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.94 
 
 
212 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8424  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.75 
 
 
185 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.719422  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  45.65 
 
 
184 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.94 
 
 
204 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.47 
 
 
203 aa  175  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.69 
 
 
203 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.15 
 
 
221 aa  175  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.31 
 
 
208 aa  174  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.83 
 
 
198 aa  174  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0057  methyladenine glycosylase  45.31 
 
 
196 aa  174  7e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.15 
 
 
225 aa  174  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1277  DNA-3-methyladenine glycosidase I  48.88 
 
 
193 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.67 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.99 
 
 
190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.34 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.72 
 
 
192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.89 
 
 
223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.45 
 
 
198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>