263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1417 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
206 aa  431  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.18 
 
 
200 aa  271  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.44 
 
 
197 aa  271  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.41 
 
 
208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  58.49 
 
 
218 aa  252  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.81 
 
 
199 aa  251  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.42 
 
 
208 aa  247  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.84 
 
 
215 aa  245  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.73 
 
 
196 aa  242  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.73 
 
 
241 aa  239  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.17 
 
 
243 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.72 
 
 
214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.69 
 
 
241 aa  238  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.55 
 
 
212 aa  238  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  65.68 
 
 
247 aa  238  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.38 
 
 
224 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.37 
 
 
209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.46 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  53.59 
 
 
215 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.41 
 
 
209 aa  224  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.82 
 
 
235 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.28 
 
 
232 aa  217  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.28 
 
 
223 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0399  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.56 
 
 
211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.176376 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1033  putative DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.83 
 
 
200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.374811  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.8 
 
 
199 aa  181  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.89 
 
 
187 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.09 
 
 
190 aa  175  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.47 
 
 
191 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.89 
 
 
199 aa  174  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.06 
 
 
263 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.39 
 
 
189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.28 
 
 
218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.35 
 
 
202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.37 
 
 
198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.84 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.89 
 
 
186 aa  171  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.94 
 
 
201 aa  171  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.99 
 
 
203 aa  171  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.89 
 
 
203 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.19 
 
 
193 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.19 
 
 
193 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.19 
 
 
193 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.28 
 
 
187 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.19 
 
 
193 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.36 
 
 
194 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.19 
 
 
193 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  47.25 
 
 
187 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.63 
 
 
191 aa  168  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  47.25 
 
 
187 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.56 
 
 
225 aa  168  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.3 
 
 
196 aa  168  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.46 
 
 
187 aa  167  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.96 
 
 
186 aa  167  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.99 
 
 
198 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.46 
 
 
187 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.85 
 
 
210 aa  167  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.9 
 
 
211 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.92 
 
 
212 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  48.04 
 
 
191 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.97 
 
 
202 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.46 
 
 
187 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.35 
 
 
195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.31 
 
 
193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.76 
 
 
198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.07 
 
 
189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  46.33 
 
 
187 aa  165  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  46.33 
 
 
187 aa  165  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.99 
 
 
198 aa  165  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.67 
 
 
193 aa  165  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  46.33 
 
 
187 aa  165  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.33 
 
 
187 aa  164  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.15 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.41 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.11 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.25 
 
 
197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.01 
 
 
223 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.49 
 
 
200 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.49 
 
 
200 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.93 
 
 
190 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.93 
 
 
191 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.36 
 
 
201 aa  162  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.7 
 
 
210 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.65 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.7 
 
 
217 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.02 
 
 
191 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
187 aa  161  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.07 
 
 
200 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.07 
 
 
200 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  43.26 
 
 
184 aa  160  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.07 
 
 
200 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0027  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.51 
 
 
189 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.32 
 
 
208 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.76 
 
 
186 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.4 
 
 
192 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.37 
 
 
198 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.89 
 
 
194 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.37 
 
 
218 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>