262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5808 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  100 
 
 
215 aa  450  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  72.25 
 
 
209 aa  325  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  72.73 
 
 
209 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  72.95 
 
 
215 aa  315  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0399  DNA-3-methyladenine glycosylase I  74.29 
 
 
211 aa  311  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.176376 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  70.19 
 
 
218 aa  307  6.999999999999999e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.35 
 
 
212 aa  293  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.5 
 
 
241 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.34 
 
 
243 aa  278  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.34 
 
 
241 aa  278  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.8 
 
 
224 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.15 
 
 
214 aa  275  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.16 
 
 
217 aa  265  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.62 
 
 
208 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.05 
 
 
208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.05 
 
 
232 aa  248  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.4 
 
 
235 aa  247  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.66 
 
 
223 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1033  putative DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.16 
 
 
200 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.374811  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.59 
 
 
197 aa  235  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.86 
 
 
199 aa  235  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.59 
 
 
206 aa  229  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.41 
 
 
200 aa  228  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.92 
 
 
196 aa  221  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  64.91 
 
 
247 aa  212  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.15 
 
 
191 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.26 
 
 
198 aa  198  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
186 aa  193  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.85 
 
 
193 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
199 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.38 
 
 
194 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 
186 aa  191  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.37 
 
 
187 aa  189  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.95 
 
 
263 aa  188  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.26 
 
 
202 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  51.4 
 
 
189 aa  186  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.47 
 
 
196 aa  186  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.29 
 
 
218 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.11 
 
 
191 aa  184  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.25 
 
 
210 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  51.1 
 
 
187 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.1 
 
 
193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.1 
 
 
193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  51.1 
 
 
187 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.1 
 
 
187 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.95 
 
 
193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.1 
 
 
193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.11 
 
 
190 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.1 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.55 
 
 
220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 
191 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.55 
 
 
193 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
202 aa  182  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.57 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.27 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1277  DNA-3-methyladenine glycosidase I  49.47 
 
 
193 aa  181  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
218 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.37 
 
 
193 aa  181  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.55 
 
 
187 aa  181  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.22 
 
 
197 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.88 
 
 
194 aa  180  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.67 
 
 
207 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.55 
 
 
187 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.55 
 
 
187 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.74 
 
 
208 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.55 
 
 
187 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.87 
 
 
187 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.48 
 
 
199 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.47 
 
 
198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.67 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.94 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  46.49 
 
 
184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.89 
 
 
198 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.4 
 
 
187 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.53 
 
 
203 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.22 
 
 
208 aa  177  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.05 
 
 
217 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.21 
 
 
202 aa  177  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.76 
 
 
203 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.74 
 
 
196 aa  176  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.73 
 
 
208 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.69 
 
 
192 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.35 
 
 
187 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.7 
 
 
196 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.63 
 
 
197 aa  176  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.74 
 
 
201 aa  175  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.03 
 
 
212 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.1 
 
 
189 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.03 
 
 
204 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.68 
 
 
192 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.46 
 
 
208 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.49 
 
 
191 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.74 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.62 
 
 
194 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.67 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  47.03 
 
 
191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.91 
 
 
186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.09 
 
 
193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.03 
 
 
190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>