265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06360 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  71.04 
 
 
192 aa  267  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.28 
 
 
263 aa  260  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  69.4 
 
 
199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.48 
 
 
193 aa  239  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.11 
 
 
208 aa  236  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  69.23 
 
 
189 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  69.06 
 
 
192 aa  232  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.02 
 
 
187 aa  231  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.49 
 
 
198 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.28 
 
 
191 aa  224  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65 
 
 
197 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.75 
 
 
227 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.58 
 
 
202 aa  217  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.37 
 
 
210 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.67 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11234  DNA-3-methyladenine glycosylase I tagA  61.26 
 
 
204 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127053  normal  0.0780895 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.06 
 
 
225 aa  209  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.14 
 
 
243 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.6 
 
 
241 aa  208  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.69 
 
 
199 aa  207  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.73 
 
 
203 aa  207  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.89 
 
 
201 aa  205  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.52 
 
 
191 aa  204  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.89 
 
 
203 aa  202  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.99 
 
 
241 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.55 
 
 
223 aa  201  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.16 
 
 
209 aa  201  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2005  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.99 
 
 
192 aa  201  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00955834  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.21 
 
 
215 aa  201  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.76 
 
 
211 aa  201  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.63 
 
 
209 aa  200  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.45 
 
 
201 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4003  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.96 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.3 
 
 
203 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.76 
 
 
217 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4077  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.96 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0485352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8424  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60 
 
 
185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.719422  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.94 
 
 
212 aa  197  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.97 
 
 
196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 
196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.69 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  54.95 
 
 
215 aa  195  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  52.63 
 
 
218 aa  194  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.45 
 
 
196 aa  192  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.08 
 
 
202 aa  192  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.44 
 
 
208 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.18 
 
 
191 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  49.15 
 
 
187 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  49.15 
 
 
187 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
187 aa  189  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.77 
 
 
210 aa  189  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.15 
 
 
187 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.15 
 
 
187 aa  189  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.44 
 
 
193 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.96 
 
 
194 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  50 
 
 
189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 
208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.89 
 
 
208 aa  188  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.45 
 
 
212 aa  188  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.56 
 
 
186 aa  188  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.2 
 
 
208 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.59 
 
 
187 aa  187  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.22 
 
 
194 aa  187  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.59 
 
 
187 aa  186  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.59 
 
 
187 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.59 
 
 
187 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.44 
 
 
187 aa  186  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.54 
 
 
202 aa  186  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.59 
 
 
187 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.13 
 
 
198 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.33 
 
 
187 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.04 
 
 
224 aa  185  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.57 
 
 
187 aa  185  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  53.41 
 
 
189 aa  184  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.49 
 
 
198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.22 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0399  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.79 
 
 
211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.176376 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.22 
 
 
193 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.22 
 
 
193 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.17 
 
 
186 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.82 
 
 
221 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.44 
 
 
196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  46.67 
 
 
193 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.35 
 
 
202 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.56 
 
 
198 aa  181  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.39 
 
 
208 aa  181  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
208 aa  180  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
218 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
191 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  46.67 
 
 
193 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.18 
 
 
209 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0062  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.14 
 
 
183 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000318334 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.41 
 
 
190 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45 
 
 
186 aa  179  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.09 
 
 
188 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.7 
 
 
183 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0348853  normal  0.0800012 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.82 
 
 
187 aa  179  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.09 
 
 
188 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.18 
 
 
209 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>