258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03399 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  100 
 
 
187 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  98.93 
 
 
187 aa  394  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  98.93 
 
 
187 aa  393  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  98.93 
 
 
187 aa  393  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  98.93 
 
 
187 aa  393  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  98.93 
 
 
187 aa  393  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  98.4 
 
 
187 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  98.4 
 
 
187 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  87.1 
 
 
193 aa  352  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  86.56 
 
 
193 aa  351  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  86.56 
 
 
193 aa  351  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  86.56 
 
 
193 aa  350  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  86.02 
 
 
193 aa  349  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  84.41 
 
 
193 aa  339  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  69.78 
 
 
187 aa  289  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.68 
 
 
187 aa  285  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  69.73 
 
 
190 aa  284  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.51 
 
 
212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  69.19 
 
 
190 aa  283  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  69.19 
 
 
190 aa  282  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.85 
 
 
186 aa  281  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.13 
 
 
187 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.52 
 
 
190 aa  240  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00010  constitutive 3-methyl-adenine DNA glycosylase I  57.69 
 
 
202 aa  238  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.95 
 
 
189 aa  228  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.49 
 
 
196 aa  227  8e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  56.11 
 
 
191 aa  224  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.7 
 
 
187 aa  224  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.7 
 
 
212 aa  223  9e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.7 
 
 
204 aa  223  9e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.56 
 
 
191 aa  223  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.56 
 
 
190 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.87 
 
 
192 aa  223  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.56 
 
 
191 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 
186 aa  221  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.59 
 
 
196 aa  220  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55 
 
 
198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55 
 
 
204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55 
 
 
200 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.93 
 
 
194 aa  218  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0027  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.89 
 
 
189 aa  218  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55 
 
 
200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.24 
 
 
194 aa  218  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.24 
 
 
198 aa  217  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.75 
 
 
191 aa  217  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.89 
 
 
192 aa  216  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  56.18 
 
 
189 aa  215  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.55 
 
 
194 aa  214  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.1 
 
 
208 aa  214  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.75 
 
 
187 aa  214  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.89 
 
 
200 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.55 
 
 
217 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.89 
 
 
186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 
196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.33 
 
 
189 aa  212  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.55 
 
 
208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.09 
 
 
191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.55 
 
 
218 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.67 
 
 
221 aa  210  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.07 
 
 
198 aa  209  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.9 
 
 
208 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.01 
 
 
188 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 
191 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.81 
 
 
199 aa  208  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.56 
 
 
190 aa  208  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
217 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.67 
 
 
213 aa  207  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.4 
 
 
223 aa  207  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  50.28 
 
 
210 aa  207  8e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.11 
 
 
220 aa  206  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.18 
 
 
186 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.9 
 
 
190 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.41 
 
 
209 aa  205  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0081  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 
183 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462301  hitchhiker  0.000000000590719 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.31 
 
 
215 aa  205  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.31 
 
 
195 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.33 
 
 
208 aa  204  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.11 
 
 
187 aa  204  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.97 
 
 
202 aa  204  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0062  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.85 
 
 
183 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000318334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.85 
 
 
209 aa  204  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.8 
 
 
202 aa  203  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.41 
 
 
194 aa  203  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.44 
 
 
198 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.56 
 
 
195 aa  202  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 
214 aa  202  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.85 
 
 
183 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0674727  hitchhiker  0.0000000000856753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.96 
 
 
198 aa  201  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.44 
 
 
198 aa  201  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.75 
 
 
198 aa  201  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.75 
 
 
183 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0348853  normal  0.0800012 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  50.28 
 
 
190 aa  200  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.84 
 
 
198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1277  DNA-3-methyladenine glycosidase I  51.7 
 
 
193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.92 
 
 
198 aa  197  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
187 aa  197  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.22 
 
 
187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.02 
 
 
186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.84 
 
 
192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>