248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0705 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
187 aa  380  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  92.35 
 
 
189 aa  322  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  71.67 
 
 
199 aa  259  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  70.33 
 
 
193 aa  249  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.18 
 
 
191 aa  243  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.41 
 
 
198 aa  238  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.05 
 
 
263 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.24 
 
 
192 aa  235  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  69.89 
 
 
192 aa  234  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.49 
 
 
193 aa  230  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2005  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.54 
 
 
192 aa  229  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00955834  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.92 
 
 
208 aa  228  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.43 
 
 
210 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.66 
 
 
218 aa  221  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.42 
 
 
202 aa  221  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.94 
 
 
203 aa  220  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11234  DNA-3-methyladenine glycosylase I tagA  60.1 
 
 
204 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127053  normal  0.0780895 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4003  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.96 
 
 
209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.77 
 
 
203 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4077  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.96 
 
 
209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0485352  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.01 
 
 
197 aa  210  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.99 
 
 
196 aa  203  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.75 
 
 
225 aa  202  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8424  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64 
 
 
185 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.719422  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.24 
 
 
196 aa  201  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.26 
 
 
241 aa  200  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.21 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.26 
 
 
243 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.66 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.61 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.98 
 
 
199 aa  195  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.4 
 
 
218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.69 
 
 
208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.69 
 
 
208 aa  194  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.21 
 
 
241 aa  193  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.94 
 
 
203 aa  193  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.07 
 
 
201 aa  190  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.94 
 
 
201 aa  190  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.09 
 
 
211 aa  189  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.63 
 
 
223 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.89 
 
 
194 aa  188  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.13 
 
 
209 aa  188  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.68 
 
 
217 aa  188  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  54.4 
 
 
215 aa  188  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.35 
 
 
208 aa  187  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.44 
 
 
208 aa  188  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.13 
 
 
209 aa  187  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.11 
 
 
194 aa  187  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0999  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.92 
 
 
195 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142815  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.06 
 
 
191 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.65 
 
 
208 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.04 
 
 
208 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.78 
 
 
194 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.46 
 
 
213 aa  185  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  55.49 
 
 
190 aa  184  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.54 
 
 
218 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.2 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.35 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.2 
 
 
209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
217 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.1 
 
 
198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.2 
 
 
199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  52.25 
 
 
189 aa  181  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 
188 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 
188 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.4 
 
 
200 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
221 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.84 
 
 
192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  48.02 
 
 
189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.54 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.75 
 
 
186 aa  177  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.85 
 
 
187 aa  177  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.93 
 
 
195 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.8 
 
 
190 aa  176  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.28 
 
 
206 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
191 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.7 
 
 
197 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.37 
 
 
202 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.56 
 
 
192 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0664  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.84 
 
 
197 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1033  putative DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.03 
 
 
200 aa  176  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.374811  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.37 
 
 
215 aa  175  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.35 
 
 
198 aa  175  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.55 
 
 
224 aa  174  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.44 
 
 
202 aa  174  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.63 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.09 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.91 
 
 
232 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 
235 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.07 
 
 
187 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0027  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.28 
 
 
189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.91 
 
 
223 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.56 
 
 
220 aa  171  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.5 
 
 
186 aa  171  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
196 aa  171  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.65 
 
 
194 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 
198 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.11 
 
 
210 aa  170  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>