258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0055 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
194 aa  397  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.93 
 
 
197 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.71 
 
 
196 aa  224  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0999  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.28 
 
 
195 aa  205  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142815  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.58 
 
 
208 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.45 
 
 
192 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.14 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.11 
 
 
263 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.36 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.76 
 
 
201 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.54 
 
 
193 aa  194  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.89 
 
 
198 aa  193  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.92 
 
 
189 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.89 
 
 
203 aa  191  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.24 
 
 
187 aa  189  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.69 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.46 
 
 
210 aa  187  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.64 
 
 
227 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.88 
 
 
225 aa  186  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.98 
 
 
218 aa  185  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.02 
 
 
203 aa  184  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.94 
 
 
193 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4003  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.36 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4077  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.36 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0485352  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.43 
 
 
201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.78 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.35 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.35 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.35 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.76 
 
 
193 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11234  DNA-3-methyladenine glycosylase I tagA  56.65 
 
 
204 aa  180  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127053  normal  0.0780895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.18 
 
 
187 aa  178  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.18 
 
 
187 aa  178  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  51.18 
 
 
187 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  51.18 
 
 
187 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.63 
 
 
192 aa  178  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.76 
 
 
193 aa  177  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.18 
 
 
187 aa  177  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.98 
 
 
190 aa  176  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.59 
 
 
187 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.59 
 
 
187 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.59 
 
 
187 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 
196 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.51 
 
 
194 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.59 
 
 
187 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.4 
 
 
199 aa  175  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.49 
 
 
191 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
223 aa  175  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.61 
 
 
208 aa  175  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.41 
 
 
190 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.11 
 
 
194 aa  175  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.54 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.85 
 
 
190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.81 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.16 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  47.37 
 
 
189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.61 
 
 
202 aa  171  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  51.69 
 
 
189 aa  171  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.35 
 
 
199 aa  171  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
215 aa  170  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
187 aa  170  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
195 aa  169  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  49.71 
 
 
190 aa  168  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.66 
 
 
195 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.15 
 
 
191 aa  168  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.65 
 
 
218 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.41 
 
 
187 aa  168  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.15 
 
 
209 aa  168  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.12 
 
 
212 aa  167  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.07 
 
 
215 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.33 
 
 
190 aa  167  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0664  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.74 
 
 
197 aa  167  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.15 
 
 
209 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0081  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.15 
 
 
183 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462301  hitchhiker  0.000000000590719 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.71 
 
 
203 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
213 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.95 
 
 
192 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.56 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.76 
 
 
186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.15 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.67 
 
 
208 aa  165  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.78 
 
 
192 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2005  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.63 
 
 
192 aa  165  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00955834  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.13 
 
 
198 aa  164  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0062  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.59 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000318334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.17 
 
 
191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.15 
 
 
183 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0674727  hitchhiker  0.0000000000856753 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.65 
 
 
208 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.17 
 
 
224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.7 
 
 
208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.75 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.24 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.72 
 
 
186 aa  162  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.59 
 
 
183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0348853  normal  0.0800012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.63 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.71 
 
 
208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>