262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5932 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
208 aa  413  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  79.46 
 
 
263 aa  290  7e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  71.04 
 
 
198 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.3 
 
 
225 aa  235  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.49 
 
 
193 aa  228  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65 
 
 
193 aa  227  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.97 
 
 
191 aa  225  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.48 
 
 
189 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.05 
 
 
192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.85 
 
 
199 aa  221  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.57 
 
 
197 aa  218  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.03 
 
 
203 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.09 
 
 
218 aa  216  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.8 
 
 
187 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.89 
 
 
227 aa  215  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.12 
 
 
202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.47 
 
 
203 aa  211  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8424  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.23 
 
 
185 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.719422  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.25 
 
 
196 aa  210  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.08 
 
 
201 aa  209  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.55 
 
 
201 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.3 
 
 
241 aa  208  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.14 
 
 
210 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.25 
 
 
202 aa  208  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.51 
 
 
203 aa  207  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.21 
 
 
243 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.69 
 
 
241 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.7 
 
 
192 aa  204  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.97 
 
 
211 aa  204  9e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.8 
 
 
223 aa  203  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11234  DNA-3-methyladenine glycosylase I tagA  60.11 
 
 
204 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127053  normal  0.0780895 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07860  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.7 
 
 
249 aa  199  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.7 
 
 
192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.93 
 
 
196 aa  194  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.89 
 
 
198 aa  193  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.36 
 
 
209 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4003  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.14 
 
 
209 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4077  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.14 
 
 
209 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0485352  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.33 
 
 
195 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.06 
 
 
199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0999  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.69 
 
 
195 aa  188  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142815  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.28 
 
 
187 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.28 
 
 
187 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.83 
 
 
194 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.28 
 
 
187 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
187 aa  187  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.36 
 
 
209 aa  187  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.64 
 
 
224 aa  187  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 
217 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  50 
 
 
187 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.12 
 
 
193 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50 
 
 
187 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  50 
 
 
187 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.93 
 
 
199 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.28 
 
 
187 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.56 
 
 
215 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.29 
 
 
194 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.25 
 
 
187 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  54.24 
 
 
189 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50 
 
 
187 aa  185  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.26 
 
 
217 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  51 
 
 
218 aa  184  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.52 
 
 
215 aa  184  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
208 aa  184  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.75 
 
 
191 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2005  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.87 
 
 
192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00955834  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
190 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
191 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
191 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.4 
 
 
232 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.4 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50 
 
 
193 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.47 
 
 
190 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
186 aa  182  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.46 
 
 
191 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.87 
 
 
200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
187 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.24 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.37 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.87 
 
 
198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.75 
 
 
208 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  48.63 
 
 
191 aa  181  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50 
 
 
193 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50 
 
 
193 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.62 
 
 
186 aa  181  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50 
 
 
193 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.05 
 
 
185 aa  181  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.03 
 
 
200 aa  181  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.34 
 
 
200 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.25 
 
 
217 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.54 
 
 
210 aa  180  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0062  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.3 
 
 
183 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000318334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.14 
 
 
183 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0348853  normal  0.0800012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.98 
 
 
196 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.75 
 
 
187 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.96 
 
 
212 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.81 
 
 
202 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.66 
 
 
190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.89 
 
 
195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>