246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11234 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11234  DNA-3-methyladenine glycosylase I tagA  100 
 
 
204 aa  418  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127053  normal  0.0780895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  71.96 
 
 
210 aa  268  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.19 
 
 
202 aa  254  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.2 
 
 
193 aa  251  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.88 
 
 
203 aa  250  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4003  DNA-3-methyladenine glycosylase I  72.49 
 
 
209 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4077  DNA-3-methyladenine glycosylase I  72.49 
 
 
209 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0485352  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.96 
 
 
199 aa  223  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.11 
 
 
208 aa  218  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.27 
 
 
197 aa  214  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.3 
 
 
189 aa  214  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.99 
 
 
191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.21 
 
 
193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.56 
 
 
192 aa  210  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.07 
 
 
187 aa  208  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.64 
 
 
192 aa  208  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.38 
 
 
198 aa  205  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.32 
 
 
263 aa  204  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.28 
 
 
196 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.29 
 
 
196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.01 
 
 
225 aa  195  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.64 
 
 
227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8424  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.34 
 
 
185 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.719422  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.56 
 
 
201 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.11 
 
 
208 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.21 
 
 
243 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.14 
 
 
218 aa  191  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.98 
 
 
241 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.05 
 
 
199 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.8 
 
 
203 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2005  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.35 
 
 
192 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00955834  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.25 
 
 
203 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.11 
 
 
211 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.85 
 
 
199 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.22 
 
 
202 aa  185  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.74 
 
 
208 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.34 
 
 
208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.39 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.25 
 
 
215 aa  182  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.74 
 
 
208 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.47 
 
 
214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.74 
 
 
194 aa  181  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.19 
 
 
241 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.26 
 
 
208 aa  180  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.04 
 
 
212 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.74 
 
 
209 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.8 
 
 
208 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  50.8 
 
 
215 aa  179  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.34 
 
 
220 aa  179  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.45 
 
 
192 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.26 
 
 
209 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  50.78 
 
 
218 aa  178  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.13 
 
 
198 aa  178  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.53 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.91 
 
 
196 aa  177  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.11 
 
 
201 aa  177  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.2 
 
 
223 aa  175  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.74 
 
 
217 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.92 
 
 
187 aa  174  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.8 
 
 
192 aa  174  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  49.47 
 
 
189 aa  174  9e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.44 
 
 
186 aa  174  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.2 
 
 
186 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  50.28 
 
 
189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.39 
 
 
187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.7 
 
 
187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.65 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.54 
 
 
185 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  46.99 
 
 
191 aa  170  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
195 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.48 
 
 
190 aa  170  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
218 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0664  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.76 
 
 
197 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
215 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.9 
 
 
198 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.21 
 
 
191 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
191 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.68 
 
 
200 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.68 
 
 
217 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0477  3-methyladenine DNA glycosylase  42.55 
 
 
196 aa  168  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0571733  normal  0.984687 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.56 
 
 
207 aa  168  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.09 
 
 
186 aa  168  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.15 
 
 
187 aa  168  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.16 
 
 
214 aa  167  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.52 
 
 
224 aa  167  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07860  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.71 
 
 
249 aa  167  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.41 
 
 
195 aa  167  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.62 
 
 
187 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  44.74 
 
 
187 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.81 
 
 
191 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  44.21 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  44.21 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  44.21 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0027  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.45 
 
 
189 aa  165  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0112451 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.21 
 
 
187 aa  165  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.31 
 
 
235 aa  165  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  44.21 
 
 
187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  44.21 
 
 
187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.26 
 
 
191 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.26 
 
 
190 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>