256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2005 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2005  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
192 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00955834  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.43 
 
 
187 aa  228  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.29 
 
 
191 aa  225  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.88 
 
 
189 aa  224  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.47 
 
 
193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.92 
 
 
199 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.04 
 
 
198 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.45 
 
 
193 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.22 
 
 
192 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.72 
 
 
263 aa  203  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.3 
 
 
192 aa  201  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.67 
 
 
203 aa  201  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.87 
 
 
208 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8424  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.65 
 
 
185 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.719422  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.63 
 
 
203 aa  193  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.07 
 
 
218 aa  191  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11234  DNA-3-methyladenine glycosylase I tagA  54.35 
 
 
204 aa  191  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127053  normal  0.0780895 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.67 
 
 
208 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.13 
 
 
210 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.59 
 
 
191 aa  187  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.11 
 
 
208 aa  185  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.2 
 
 
199 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.94 
 
 
241 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.95 
 
 
203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.54 
 
 
200 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.54 
 
 
200 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.54 
 
 
200 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
194 aa  181  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4003  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.6 
 
 
209 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4077  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.6 
 
 
209 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0485352  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.76 
 
 
202 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.85 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
196 aa  178  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.98 
 
 
200 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.56 
 
 
195 aa  177  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 
197 aa  177  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.52 
 
 
213 aa  177  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.34 
 
 
212 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.34 
 
 
241 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  51.1 
 
 
190 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.89 
 
 
196 aa  175  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
202 aa  175  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.85 
 
 
201 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  50.57 
 
 
189 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.85 
 
 
201 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.41 
 
 
200 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.62 
 
 
243 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.89 
 
 
209 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.07 
 
 
202 aa  175  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.06 
 
 
225 aa  175  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.4 
 
 
198 aa  174  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.92 
 
 
214 aa  174  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.4 
 
 
209 aa  174  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.85 
 
 
208 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.83 
 
 
211 aa  174  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.1 
 
 
188 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.1 
 
 
188 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.4 
 
 
209 aa  174  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.83 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.24 
 
 
215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0399  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.47 
 
 
211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.176376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.5 
 
 
198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.81 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.82 
 
 
192 aa  171  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.37 
 
 
209 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.65 
 
 
200 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.03 
 
 
201 aa  171  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  46.11 
 
 
215 aa  171  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  46.74 
 
 
190 aa  171  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.34 
 
 
221 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.42 
 
 
194 aa  170  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.7 
 
 
212 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.07 
 
 
202 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.67 
 
 
194 aa  170  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.67 
 
 
187 aa  170  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.96 
 
 
200 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  47.62 
 
 
218 aa  169  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0664  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.15 
 
 
197 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  46.74 
 
 
190 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.89 
 
 
186 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 
195 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.96 
 
 
186 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.67 
 
 
187 aa  168  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.41 
 
 
200 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.11 
 
 
189 aa  168  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.41 
 
 
198 aa  168  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  46.37 
 
 
189 aa  168  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.8 
 
 
207 aa  167  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  49.15 
 
 
202 aa  167  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.62 
 
 
186 aa  167  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.88 
 
 
187 aa  167  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  45.76 
 
 
191 aa  167  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.38 
 
 
210 aa  167  8e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.09 
 
 
198 aa  167  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.35 
 
 
198 aa  167  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.51 
 
 
208 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.3 
 
 
190 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.3 
 
 
191 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.81 
 
 
217 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1033  putative DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.92 
 
 
200 aa  167  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.374811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>