259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0664 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0664  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
197 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.38 
 
 
225 aa  239  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.59 
 
 
201 aa  228  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.34 
 
 
227 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.26 
 
 
203 aa  218  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.2 
 
 
201 aa  214  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.32 
 
 
211 aa  209  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.15 
 
 
202 aa  202  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.61 
 
 
198 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.35 
 
 
193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.35 
 
 
208 aa  188  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.38 
 
 
187 aa  187  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.01 
 
 
218 aa  187  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.22 
 
 
189 aa  185  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07860  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.3 
 
 
249 aa  182  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.75 
 
 
199 aa  181  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.74 
 
 
193 aa  177  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.11 
 
 
263 aa  175  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11234  DNA-3-methyladenine glycosylase I tagA  50.76 
 
 
204 aa  174  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127053  normal  0.0780895 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.63 
 
 
191 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.74 
 
 
194 aa  173  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2005  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.15 
 
 
192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00955834  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.38 
 
 
192 aa  171  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.15 
 
 
196 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.18 
 
 
203 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
210 aa  167  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.93 
 
 
195 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.89 
 
 
192 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.96 
 
 
191 aa  165  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.89 
 
 
202 aa  165  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.58 
 
 
232 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.51 
 
 
202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.45 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.58 
 
 
223 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.9 
 
 
199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.57 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 
197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.81 
 
 
196 aa  161  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.7 
 
 
202 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.64 
 
 
214 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.07 
 
 
190 aa  159  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.2 
 
 
186 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  47.16 
 
 
189 aa  158  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.62 
 
 
206 aa  158  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.58 
 
 
194 aa  158  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.55 
 
 
221 aa  157  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.83 
 
 
224 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.44 
 
 
193 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.02 
 
 
200 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.02 
 
 
200 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.02 
 
 
200 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.92 
 
 
203 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
235 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.9 
 
 
188 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  45.83 
 
 
215 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.2 
 
 
208 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.9 
 
 
188 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.98 
 
 
196 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.91 
 
 
208 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
208 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0477  3-methyladenine DNA glycosylase  43.46 
 
 
196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0571733  normal  0.984687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.85 
 
 
218 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.01 
 
 
208 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.99 
 
 
187 aa  154  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.16 
 
 
200 aa  154  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1277  DNA-3-methyladenine glycosidase I  43.24 
 
 
193 aa  154  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.32 
 
 
192 aa  154  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.96 
 
 
217 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45 
 
 
220 aa  154  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.32 
 
 
197 aa  153  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  44.81 
 
 
190 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.89 
 
 
200 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.65 
 
 
208 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4003  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.95 
 
 
209 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4077  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.95 
 
 
209 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0485352  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.39 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.89 
 
 
198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.75 
 
 
217 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.51 
 
 
191 aa  151  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0983  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  38.71 
 
 
192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.01 
 
 
190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.89 
 
 
200 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.17 
 
 
198 aa  151  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.04 
 
 
209 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.56 
 
 
209 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.47 
 
 
208 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.31 
 
 
217 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  44.79 
 
 
218 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2291  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.2 
 
 
186 aa  149  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.66 
 
 
204 aa  149  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.73 
 
 
243 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.3 
 
 
186 aa  149  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.76 
 
 
201 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.09 
 
 
191 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.76 
 
 
201 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.66 
 
 
212 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.71 
 
 
215 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.42 
 
 
241 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  43.02 
 
 
189 aa  148  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.22 
 
 
241 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>