255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0687 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
263 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  79.46 
 
 
208 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.28 
 
 
193 aa  252  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  70.81 
 
 
198 aa  248  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.77 
 
 
193 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.85 
 
 
191 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.06 
 
 
199 aa  231  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.1 
 
 
225 aa  228  8e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.22 
 
 
189 aa  225  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.52 
 
 
187 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.29 
 
 
197 aa  221  9e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.78 
 
 
203 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.69 
 
 
218 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.71 
 
 
192 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.51 
 
 
227 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.67 
 
 
211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.9 
 
 
203 aa  211  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8424  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.75 
 
 
185 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.719422  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.76 
 
 
201 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.07 
 
 
210 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.16 
 
 
192 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.36 
 
 
201 aa  208  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.37 
 
 
202 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.22 
 
 
241 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.25 
 
 
203 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.04 
 
 
202 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.15 
 
 
196 aa  201  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.89 
 
 
223 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.29 
 
 
243 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.29 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.84 
 
 
217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.56 
 
 
209 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.32 
 
 
209 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.72 
 
 
214 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.4 
 
 
215 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.01 
 
 
198 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4003  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.42 
 
 
209 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4077  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.42 
 
 
209 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0485352  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.85 
 
 
196 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
212 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07860  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.43 
 
 
249 aa  193  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.51 
 
 
208 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.32 
 
 
194 aa  191  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11234  DNA-3-methyladenine glycosylase I tagA  56.32 
 
 
204 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127053  normal  0.0780895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.14 
 
 
208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2005  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.72 
 
 
192 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00955834  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  49.72 
 
 
187 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  49.72 
 
 
187 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  54.95 
 
 
215 aa  188  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  188  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.49 
 
 
191 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.37 
 
 
199 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.75 
 
 
224 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0999  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.71 
 
 
195 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142815  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.15 
 
 
187 aa  186  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.15 
 
 
187 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.15 
 
 
187 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.15 
 
 
187 aa  185  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.19 
 
 
193 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  52.13 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  53.98 
 
 
189 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.19 
 
 
199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.85 
 
 
194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.11 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.84 
 
 
192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.19 
 
 
193 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.19 
 
 
187 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.19 
 
 
193 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.09 
 
 
193 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.65 
 
 
193 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.65 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.38 
 
 
195 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.67 
 
 
194 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.08 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.08 
 
 
232 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.69 
 
 
191 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.89 
 
 
213 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.41 
 
 
186 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.63 
 
 
218 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  48.09 
 
 
189 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.46 
 
 
208 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.52 
 
 
200 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.91 
 
 
207 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.58 
 
 
210 aa  179  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.81 
 
 
191 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.09 
 
 
217 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.77 
 
 
209 aa  178  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.37 
 
 
208 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.15 
 
 
198 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.51 
 
 
209 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.84 
 
 
195 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.41 
 
 
200 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.44 
 
 
187 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.83 
 
 
208 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.27 
 
 
215 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>