245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0781 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  70.49 
 
 
193 aa  254  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  71.02 
 
 
192 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.09 
 
 
199 aa  234  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.67 
 
 
193 aa  224  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.24 
 
 
187 aa  222  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.05 
 
 
189 aa  221  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.71 
 
 
263 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.22 
 
 
208 aa  217  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.22 
 
 
202 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.5 
 
 
210 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.45 
 
 
191 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.67 
 
 
198 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.69 
 
 
199 aa  207  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.06 
 
 
203 aa  203  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4003  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.5 
 
 
209 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.07 
 
 
196 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4077  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.5 
 
 
209 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0485352  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.22 
 
 
197 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11234  DNA-3-methyladenine glycosylase I tagA  58.01 
 
 
204 aa  199  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127053  normal  0.0780895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.65 
 
 
218 aa  197  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.09 
 
 
194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.78 
 
 
193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.66 
 
 
191 aa  193  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.59 
 
 
218 aa  189  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.19 
 
 
208 aa  189  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.45 
 
 
187 aa  189  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.28 
 
 
187 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  50.28 
 
 
187 aa  188  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  50.28 
 
 
187 aa  188  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.28 
 
 
187 aa  187  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.28 
 
 
187 aa  187  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0999  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.38 
 
 
195 aa  186  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142815  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8424  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.29 
 
 
185 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.719422  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.78 
 
 
208 aa  186  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.18 
 
 
201 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  185  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  185  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2005  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.3 
 
 
192 aa  185  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00955834  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.47 
 
 
194 aa  185  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  185  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  185  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
187 aa  185  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.89 
 
 
227 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.63 
 
 
243 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.89 
 
 
193 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.22 
 
 
186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.11 
 
 
208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.52 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  48.91 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.41 
 
 
201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.53 
 
 
215 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.89 
 
 
193 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.89 
 
 
193 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.91 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.51 
 
 
241 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.52 
 
 
217 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.96 
 
 
218 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.67 
 
 
241 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.33 
 
 
193 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.33 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.75 
 
 
225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.11 
 
 
223 aa  181  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.82 
 
 
192 aa  180  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.45 
 
 
209 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.54 
 
 
202 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.75 
 
 
190 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 
186 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.91 
 
 
187 aa  179  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.45 
 
 
191 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0062  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.7 
 
 
183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000318334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.48 
 
 
209 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.17 
 
 
196 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
200 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.84 
 
 
200 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.27 
 
 
183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0348853  normal  0.0800012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.39 
 
 
198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.68 
 
 
208 aa  178  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.96 
 
 
209 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
211 aa  177  5.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.23 
 
 
203 aa  177  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.22 
 
 
196 aa  177  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.57 
 
 
192 aa  177  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.42 
 
 
214 aa  177  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.89 
 
 
198 aa  176  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  48.59 
 
 
191 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.81 
 
 
191 aa  176  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  47.69 
 
 
215 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.4 
 
 
202 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.6 
 
 
194 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.12 
 
 
200 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.96 
 
 
203 aa  176  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.89 
 
 
190 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.22 
 
 
212 aa  176  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>