265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0662 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  100 
 
 		 247 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.68 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.1 
 
 		 200 aa  241  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  63.74 
 
 		 218 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.67 
 
 		 199 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.53 
 
 		 197 aa  238  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.64 
 
 		 215 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.54 
 
 		 212 aa  231  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.75 
 
 		 208 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.41 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.57 
 
 		 214 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.41 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.28 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.45 
 
 		 196 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.01 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.36 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.62 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.57 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  64.91 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.64 
 
 		 235 aa  218  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.89 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.57 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.57 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0399  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.89 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.176376 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1033  putative DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.41 
 
 		 200 aa  192  5e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.374811  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.04 
 
 		 198 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.3 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.98 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 		 203 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.76 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.76 
 
 		 193 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.76 
 
 		 193 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48 
 
 		 202 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.76 
 
 		 193 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.89 
 
 		 198 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.49 
 
 		 191 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.42 
 
 		 187 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.41 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.41 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.18 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.41 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.82 
 
 		 187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  48.82 
 
 		 187 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.49 
 
 		 201 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.82 
 
 		 187 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  48.82 
 
 		 187 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.71 
 
 		 193 aa  165  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.75 
 
 		 186 aa  165  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.82 
 
 		 187 aa  164  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.11 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.28 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.3 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.59 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.82 
 
 		 191 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.24 
 
 		 187 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  46.78 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.75 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  52.05 
 
 		 189 aa  161  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.11 
 
 		 191 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.43 
 
 		 218 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.81 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.7 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.33 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.41 
 
 		 193 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.06 
 
 		 186 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.41 
 
 		 198 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.14 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.41 
 
 		 198 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.77 
 
 		 193 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  43.33 
 
 		 184 aa  159  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.13 
 
 		 201 aa  158  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.47 
 
 		 194 aa  158  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.55 
 
 		 212 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 		 192 aa  158  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 		 192 aa  158  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.12 
 
 		 189 aa  158  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.34 
 
 		 187 aa  158  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.03 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.34 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.03 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.24 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.33 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.24 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.82 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.75 
 
 		 190 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.3 
 
 		 187 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.89 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.7 
 
 		 194 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.75 
 
 		 190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.35 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.43 
 
 		 209 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.48 
 
 		 198 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.56 
 
 		 187 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.75 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.13 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0730  3-methyladenine DNA glycosylase  45.88 
 
 		 184 aa  154  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.45 
 
 		 221 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.24 
 
 		 223 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.18 
 
 		 185 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>