248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0272 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0272  50S ribosomal protein L24 (BL23; 12 kDa DNA-binding protein; HPB12)  100 
 
 
185 aa  376  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0983  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  51.65 
 
 
192 aa  208  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl277  DNA-3-methyladenine glycosidase  53.01 
 
 
187 aa  205  3e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000678325  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.56 
 
 
186 aa  201  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.78 
 
 
190 aa  198  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0467  yggt family protein  50 
 
 
192 aa  197  7.999999999999999e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2291  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.85 
 
 
186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.59 
 
 
197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.35 
 
 
187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
186 aa  194  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.96 
 
 
193 aa  192  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.83 
 
 
183 aa  189  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1933  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.04 
 
 
193 aa  187  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23730  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.15 
 
 
183 aa  186  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00337474  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.25 
 
 
194 aa  184  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0678  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
189 aa  184  8e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000050702 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  43.48 
 
 
190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2095  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45 
 
 
183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.44 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
191 aa  181  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  45.3 
 
 
190 aa  180  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.11 
 
 
198 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  45.3 
 
 
190 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  46.07 
 
 
189 aa  177  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.48 
 
 
188 aa  177  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.48 
 
 
188 aa  177  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.07 
 
 
192 aa  177  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2670  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.86 
 
 
192 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0484172  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.65 
 
 
196 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.22 
 
 
190 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.56 
 
 
198 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.15 
 
 
220 aa  175  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.33 
 
 
202 aa  175  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.41 
 
 
186 aa  175  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.37 
 
 
212 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.37 
 
 
204 aa  174  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.32 
 
 
191 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.2 
 
 
210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.05 
 
 
187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0057  methyladenine glycosylase  43.58 
 
 
196 aa  171  5e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.08 
 
 
200 aa  171  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.69 
 
 
196 aa  170  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  41.67 
 
 
184 aa  170  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.99 
 
 
208 aa  168  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.26 
 
 
191 aa  168  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.99 
 
 
208 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0312  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.65 
 
 
201 aa  168  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.547447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.09 
 
 
218 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.38 
 
 
190 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.02 
 
 
199 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.09 
 
 
217 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1277  DNA-3-methyladenine glycosidase I  46.59 
 
 
193 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.39 
 
 
217 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.3 
 
 
198 aa  164  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.46 
 
 
207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0241  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.98 
 
 
195 aa  164  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.98 
 
 
185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.76 
 
 
198 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1094  methyladenine glycosylase  42.46 
 
 
186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.76 
 
 
194 aa  160  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.78 
 
 
198 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.81 
 
 
198 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.23 
 
 
208 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.22 
 
 
208 aa  158  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.34 
 
 
192 aa  158  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.12 
 
 
196 aa  157  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0235  methyladenine glycosylase  44.69 
 
 
183 aa  156  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  39.56 
 
 
202 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.71 
 
 
187 aa  156  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.56 
 
 
202 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.59 
 
 
187 aa  156  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  39.56 
 
 
202 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.11 
 
 
198 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.23 
 
 
187 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  39.01 
 
 
202 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.33 
 
 
218 aa  155  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  39.01 
 
 
202 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.89 
 
 
191 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  39.01 
 
 
202 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  39.01 
 
 
202 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0857  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.88 
 
 
198 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.671236  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0730  3-methyladenine DNA glycosylase  43.33 
 
 
184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.11 
 
 
194 aa  154  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.45 
 
 
198 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.78 
 
 
189 aa  154  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.8 
 
 
187 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.91 
 
 
212 aa  152  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.04 
 
 
186 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.22 
 
 
190 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.55 
 
 
186 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.58 
 
 
215 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.89 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.89 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  40.86 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.89 
 
 
200 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.89 
 
 
200 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.04 
 
 
191 aa  151  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.89 
 
 
200 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.04 
 
 
191 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>