251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23730 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_23730  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
183 aa  380  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00337474  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.5 
 
 
190 aa  223  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.04 
 
 
193 aa  209  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.24 
 
 
202 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2291  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.38 
 
 
186 aa  206  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.49 
 
 
191 aa  203  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.54 
 
 
194 aa  202  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 
186 aa  202  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.56 
 
 
191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0983  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  53.33 
 
 
192 aa  197  7e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.59 
 
 
190 aa  197  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.15 
 
 
190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.56 
 
 
196 aa  195  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 
197 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.85 
 
 
198 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1933  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.25 
 
 
193 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.83 
 
 
187 aa  193  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
198 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2670  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.88 
 
 
192 aa  192  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0484172  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.89 
 
 
183 aa  191  6e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.44 
 
 
191 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0272  50S ribosomal protein L24 (BL23; 12 kDa DNA-binding protein; HPB12)  49.15 
 
 
185 aa  186  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  48.88 
 
 
190 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.78 
 
 
210 aa  185  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  48.88 
 
 
190 aa  184  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.63 
 
 
186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.38 
 
 
198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.22 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  46.07 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.85 
 
 
192 aa  182  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.59 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0857  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
198 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.671236  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.59 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.38 
 
 
200 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.2 
 
 
198 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
191 aa  180  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.8 
 
 
186 aa  179  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0027  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.51 
 
 
189 aa  180  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.38 
 
 
200 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.51 
 
 
214 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.63 
 
 
196 aa  179  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.38 
 
 
204 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.15 
 
 
207 aa  178  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.38 
 
 
191 aa  178  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.33 
 
 
189 aa  178  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  47.46 
 
 
190 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.38 
 
 
190 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl277  DNA-3-methyladenine glycosidase  45.2 
 
 
187 aa  177  7e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000678325  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0678  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.59 
 
 
189 aa  177  7e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000050702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.86 
 
 
194 aa  176  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.67 
 
 
199 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1277  DNA-3-methyladenine glycosidase I  46.33 
 
 
193 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.07 
 
 
198 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  46.33 
 
 
189 aa  176  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.63 
 
 
187 aa  175  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.38 
 
 
196 aa  175  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.2 
 
 
204 aa  174  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.2 
 
 
212 aa  174  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.41 
 
 
187 aa  174  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  45.86 
 
 
189 aa  174  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1094  methyladenine glycosylase  43.26 
 
 
186 aa  174  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.63 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0312  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.26 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.547447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.2 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.94 
 
 
208 aa  170  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0235  methyladenine glycosylase  45.56 
 
 
183 aa  170  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.6 
 
 
192 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.67 
 
 
187 aa  170  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.76 
 
 
186 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2095  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.65 
 
 
183 aa  169  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.63 
 
 
217 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0057  methyladenine glycosylase  40.68 
 
 
196 aa  167  6e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.37 
 
 
187 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  45.76 
 
 
193 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.3 
 
 
200 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.2 
 
 
220 aa  166  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.07 
 
 
187 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.07 
 
 
202 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.26 
 
 
218 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  45.76 
 
 
193 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  45.76 
 
 
193 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.7 
 
 
208 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  45.76 
 
 
193 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  41.3 
 
 
184 aa  165  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  45.76 
 
 
193 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.13 
 
 
200 aa  164  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.94 
 
 
208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0467  yggt family protein  45.41 
 
 
192 aa  164  8e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0241  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.39 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.57 
 
 
190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.5 
 
 
217 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.01 
 
 
192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.7 
 
 
194 aa  160  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.67 
 
 
212 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.24 
 
 
208 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.13 
 
 
185 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1722  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.67 
 
 
186 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1756  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.67 
 
 
186 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.792087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>