260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0477 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0477  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 
196 aa  408  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0571733  normal  0.984687 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2291  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
186 aa  203  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.45 
 
 
186 aa  198  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.55 
 
 
186 aa  197  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.16 
 
 
210 aa  188  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.75 
 
 
187 aa  188  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.24 
 
 
220 aa  188  5e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.07 
 
 
187 aa  184  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.42 
 
 
194 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.77 
 
 
195 aa  181  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.09 
 
 
187 aa  181  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  46.45 
 
 
184 aa  181  7e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.88 
 
 
190 aa  180  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  49.45 
 
 
189 aa  180  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0857  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.58 
 
 
198 aa  180  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.671236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.67 
 
 
218 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.2 
 
 
186 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.9 
 
 
199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.75 
 
 
190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.75 
 
 
198 aa  178  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.6 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.38 
 
 
199 aa  177  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2095  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.65 
 
 
183 aa  177  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.21 
 
 
217 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.38 
 
 
212 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.89 
 
 
197 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.6 
 
 
191 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0312  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.09 
 
 
201 aa  176  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.547447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.82 
 
 
200 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.93 
 
 
193 aa  174  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.49 
 
 
192 aa  174  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.11 
 
 
208 aa  174  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.51 
 
 
187 aa  174  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.9 
 
 
263 aa  174  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44 
 
 
208 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.38 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.04 
 
 
224 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.82 
 
 
192 aa  173  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.6 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.57 
 
 
210 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  46.99 
 
 
215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.51 
 
 
217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.86 
 
 
208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  45.51 
 
 
189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.94 
 
 
191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  45.36 
 
 
187 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  45.36 
 
 
187 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  45.36 
 
 
187 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  45.36 
 
 
187 aa  171  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  45.36 
 
 
187 aa  171  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.44 
 
 
217 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.62 
 
 
214 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.36 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  45.36 
 
 
187 aa  170  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  45.36 
 
 
187 aa  170  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.09 
 
 
243 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.05 
 
 
185 aa  170  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.44 
 
 
208 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.65 
 
 
202 aa  170  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.05 
 
 
187 aa  170  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
213 aa  170  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.26 
 
 
209 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.7 
 
 
194 aa  170  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.2 
 
 
192 aa  169  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl277  DNA-3-methyladenine glycosidase  43.41 
 
 
187 aa  169  2e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000678325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.55 
 
 
241 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.38 
 
 
196 aa  169  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  44.81 
 
 
187 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0678  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.76 
 
 
189 aa  169  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000050702 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2670  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.86 
 
 
192 aa  169  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0484172  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45 
 
 
193 aa  169  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.88 
 
 
198 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.32 
 
 
235 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
191 aa  168  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.7 
 
 
223 aa  168  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  43.72 
 
 
193 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.41 
 
 
189 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.7 
 
 
209 aa  167  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.81 
 
 
232 aa  168  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.63 
 
 
198 aa  167  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.69 
 
 
190 aa  167  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.24 
 
 
198 aa  167  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  43.72 
 
 
193 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.62 
 
 
241 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  43.72 
 
 
193 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.2 
 
 
198 aa  167  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.82 
 
 
207 aa  167  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.16 
 
 
212 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.72 
 
 
186 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.47 
 
 
203 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.33 
 
 
202 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
191 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.03 
 
 
202 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.51 
 
 
200 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
204 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  43.17 
 
 
193 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.26 
 
 
223 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.78 
 
 
208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.51 
 
 
200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  43.17 
 
 
193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>