141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4062 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4062  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 		 229 aa  474  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195158  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0129  3-methyladenine DNA glycosylase  76.42 
 
 		 237 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0127  3-methyladenine DNA glycosylase  71.18 
 
 		 229 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4214  methyladenine glycosylase  71.18 
 
 		 229 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4389  3-methyladenine DNA glycosylase  71.18 
 
 		 229 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4253  3-methyladenine DNA glycosylase  70.31 
 
 		 229 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3932  3-methyladenine DNA glycosylase  70.74 
 
 		 229 aa  350  8e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4048  3-methyladenine DNA glycosylase  69.87 
 
 		 229 aa  348  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3839  3-methyladenine DNA glycosylase  69.87 
 
 		 229 aa  348  4e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0150  3-methyladenine DNA glycosylase  72.93 
 
 		 229 aa  348  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0029  3-methyladenine DNA glycosylase  69 
 
 		 229 aa  347  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4696  3-methyladenine DNA glycosylase  69.43 
 
 		 229 aa  344  6e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3866  3-methyladenine DNA glycosylase  65.49 
 
 		 228 aa  331  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3551  3-methyladenine DNA glycosylase  63.44 
 
 		 228 aa  328  6e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4208  hypothetical protein  52.42 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02522  3-methyl-adenine DNA glycosylase  52.21 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003561  hypothetical protein  51.33 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03491  3-methyl-adenine DNA glycosylase  47.79 
 
 		 233 aa  241  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2831  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.2 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.899123  normal  0.113104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4987  hypothetical protein  46.61 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0280  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  43.24 
 
 		 222 aa  205  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.579527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48860  hypothetical protein  44.14 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00328607  hitchhiker  0.0000000197287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4185  hypothetical protein  43.24 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2960  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  42.86 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208736  normal  0.0259556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1642  hypothetical protein  43.06 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4075  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  43.06 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1244  DNA-glycosylase  42.58 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1204  DNA-glycosylase  42.11 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33200  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  44.02 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1166  hypothetical protein  41.1 
 
 		 226 aa  178  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159746  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3704  hypothetical protein  40.67 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2049  hypothetical protein  39.73 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.443421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0212  putative DNA glycosylase protein  40.91 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4231  hypothetical protein  41.23 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359508  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1685  hypothetical protein  38.76 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1573  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.31 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.31 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.54 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.69 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.34 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.57 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.45 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.57 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.57 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.34 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.74 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  26.03 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0730  3-methyladenine DNA glycosylase  25.55 
 
 		 184 aa  52  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  26.67 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.67 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  26.67 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  26.67 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  26.67 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  26.67 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  26.67 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.83 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0938  methyladenine glycosylase  27.48 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.57 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  24.84 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.03 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.1 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.46 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  28.57 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.71 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.25 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.74 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.21 
 
 		 188 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.37 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.21 
 
 		 188 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  23.53 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1094  methyladenine glycosylase  30.43 
 
 		 186 aa  48.5  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2095  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.57 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.48 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.92 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  24.14 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.63 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.84 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01997  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.56 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07860  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.14 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.52 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1033  putative DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.47 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.374811  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1722  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.26 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1756  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.26 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.792087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.93 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3455  methyladenine glycosylase  28.57 
 
 		 183 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0251027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.26 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  27.27 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.26 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1297  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.72 
 
 		 179 aa  47  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.83 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.09 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.26 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.57 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.21 
 
 		 196 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.79 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.24 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.26 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.26 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.67 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.27 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>