175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4389 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0127  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 
229 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4389  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 
229 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4214  methyladenine glycosylase  99.56 
 
 
229 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4253  3-methyladenine DNA glycosylase  98.25 
 
 
229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3839  3-methyladenine DNA glycosylase  89.08 
 
 
229 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3932  3-methyladenine DNA glycosylase  89.96 
 
 
229 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4696  3-methyladenine DNA glycosylase  88.65 
 
 
229 aa  424  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4048  3-methyladenine DNA glycosylase  88.21 
 
 
229 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0129  3-methyladenine DNA glycosylase  75.11 
 
 
237 aa  359  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310966  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0150  3-methyladenine DNA glycosylase  75.55 
 
 
229 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4062  3-methyladenine DNA glycosylase  71.18 
 
 
229 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0029  3-methyladenine DNA glycosylase  71.18 
 
 
229 aa  348  4e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176771  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3866  3-methyladenine DNA glycosylase  69.91 
 
 
228 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3551  3-methyladenine DNA glycosylase  67.84 
 
 
228 aa  325  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4208  hypothetical protein  53.74 
 
 
235 aa  259  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03491  3-methyl-adenine DNA glycosylase  50.88 
 
 
233 aa  247  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02522  3-methyl-adenine DNA glycosylase  51.33 
 
 
228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003561  hypothetical protein  51.33 
 
 
228 aa  241  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2831  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.65 
 
 
224 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.899123  normal  0.113104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4987  hypothetical protein  45.76 
 
 
243 aa  226  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2960  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  47.62 
 
 
223 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208736  normal  0.0259556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4185  hypothetical protein  45.21 
 
 
223 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48860  hypothetical protein  42.92 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00328607  hitchhiker  0.0000000197287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33200  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  45.24 
 
 
223 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0280  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  39.19 
 
 
222 aa  181  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.579527  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1642  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1244  DNA-glycosylase  43.81 
 
 
223 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4075  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  42.86 
 
 
223 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1204  DNA-glycosylase  43.33 
 
 
223 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4231  hypothetical protein  44.29 
 
 
224 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359508  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1166  hypothetical protein  40.27 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159746  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0212  putative DNA glycosylase protein  40.91 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3704  hypothetical protein  39.52 
 
 
223 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1685  hypothetical protein  39.52 
 
 
223 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2049  hypothetical protein  38.36 
 
 
222 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.443421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.45 
 
 
200 aa  62  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.57 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.77 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.86 
 
 
199 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1573  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.08 
 
 
177 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  25 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.09 
 
 
197 aa  55.8  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.32 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  24.49 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.37 
 
 
190 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.07 
 
 
190 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.06 
 
 
224 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.07 
 
 
190 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.71 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.6 
 
 
198 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  30.34 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.34 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  30.34 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  30.34 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  30.34 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  30.34 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  30.34 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.81 
 
 
193 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.64 
 
 
194 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  28.72 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.34 
 
 
198 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.75 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.03 
 
 
196 aa  52.4  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  29.45 
 
 
193 aa  52.4  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  23.24 
 
 
190 aa  52  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.56 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.6 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.66 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.6 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.3 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.53 
 
 
194 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.68 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.75 
 
 
201 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.4 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.33 
 
 
209 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  23.87 
 
 
190 aa  49.3  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  29.86 
 
 
187 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.03 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.33 
 
 
193 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  27.97 
 
 
184 aa  49.3  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0730  3-methyladenine DNA glycosylase  23.94 
 
 
184 aa  48.9  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.53 
 
 
200 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.61 
 
 
191 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  29.17 
 
 
187 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.82 
 
 
202 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.47 
 
 
200 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.47 
 
 
200 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.47 
 
 
200 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  29.17 
 
 
187 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1229  DNA-3-methyladenine glycosylase I, putative  20.67 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.164878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.19 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  29.17 
 
 
187 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.47 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.52 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.91 
 
 
208 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0467  yggt family protein  24.84 
 
 
192 aa  47.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.43 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.17 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.22 
 
 
196 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>