145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003561 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003561  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02522  3-methyl-adenine DNA glycosylase  93.86 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2831  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.09 
 
 		 224 aa  278  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.899123  normal  0.113104 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03491  3-methyl-adenine DNA glycosylase  56.95 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3551  3-methyladenine DNA glycosylase  54.39 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4208  hypothetical protein  52.89 
 
 		 235 aa  248  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4062  3-methyladenine DNA glycosylase  51.33 
 
 		 229 aa  246  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195158  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3932  3-methyladenine DNA glycosylase  51.77 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4214  methyladenine glycosylase  51.33 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4987  hypothetical protein  50.63 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0127  3-methyladenine DNA glycosylase  51.33 
 
 		 229 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4389  3-methyladenine DNA glycosylase  51.33 
 
 		 229 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3839  3-methyladenine DNA glycosylase  51.33 
 
 		 229 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4048  3-methyladenine DNA glycosylase  51.33 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4253  3-methyladenine DNA glycosylase  51.33 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4696  3-methyladenine DNA glycosylase  50.44 
 
 		 229 aa  238  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0029  3-methyladenine DNA glycosylase  49.56 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3866  3-methyladenine DNA glycosylase  48.25 
 
 		 228 aa  228  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0150  3-methyladenine DNA glycosylase  51.33 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0129  3-methyladenine DNA glycosylase  50 
 
 		 237 aa  224  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2960  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  42.33 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208736  normal  0.0259556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33200  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  41.86 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48860  hypothetical protein  42.33 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00328607  hitchhiker  0.0000000197287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1244  DNA-glycosylase  41.4 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1642  hypothetical protein  40.47 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4075  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  40.47 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4185  hypothetical protein  41.4 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0280  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  40.54 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.579527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4231  hypothetical protein  41.67 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359508  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1204  DNA-glycosylase  40.47 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1166  hypothetical protein  40.99 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159746  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3704  hypothetical protein  41.35 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1685  hypothetical protein  39.9 
 
 		 223 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0212  putative DNA glycosylase protein  42.47 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2049  hypothetical protein  38.74 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.443421 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2095  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.04 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1573  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.34 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.74 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.67 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  28.67 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  28.67 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.6 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.01 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  27.97 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  27.97 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.25 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  27.97 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  27.97 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  27.97 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.92 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.27 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0730  3-methyladenine DNA glycosylase  26.42 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.52 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.33 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.58 
 
 		 190 aa  53.1  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.88 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.89 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.88 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0272  50S ribosomal protein L24 (BL23; 12 kDa DNA-binding protein; HPB12)  27 
 
 		 185 aa  52.8  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.07 
 
 		 198 aa  52.4  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.27 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.97 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.97 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1033  putative DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.09 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.374811  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.71 
 
 		 191 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.97 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  32.56 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.61 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0235  methyladenine glycosylase  27.78 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07860  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.5 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.67 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0312  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.547447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.97 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0938  methyladenine glycosylase  26.67 
 
 		 180 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245904 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.27 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.52 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.77 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.96 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.11 
 
 		 187 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.61 
 
 		 186 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2670  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.4 
 
 		 192 aa  48.9  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0484172  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.43 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.43 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.34 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.21 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.21 
 
 		 232 aa  48.5  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.21 
 
 		 227 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003808  DNA-3-methyladenine glycosylase  25.6 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  27.14 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.14 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1277  DNA-3-methyladenine glycosidase I  23.75 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1297  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  29.21 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.6 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0241  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.24 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3910  methyladenine glycosylase  30.93 
 
 		 181 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0771426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01997  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.41 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl277  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.04 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000678325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1094  methyladenine glycosylase  32.89 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0983  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  26.86 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>