123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2831 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2831  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
224 aa  472  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.899123  normal  0.113104 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003561  hypothetical protein  60.09 
 
 
228 aa  278  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02522  3-methyl-adenine DNA glycosylase  59.91 
 
 
228 aa  274  9e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4208  hypothetical protein  56.82 
 
 
235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03491  3-methyl-adenine DNA glycosylase  55.2 
 
 
233 aa  264  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3551  3-methyladenine DNA glycosylase  51.34 
 
 
228 aa  238  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4062  3-methyladenine DNA glycosylase  48.2 
 
 
229 aa  236  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195158  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3932  3-methyladenine DNA glycosylase  49.55 
 
 
229 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3839  3-methyladenine DNA glycosylase  49.1 
 
 
229 aa  235  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4048  3-methyladenine DNA glycosylase  48.65 
 
 
229 aa  234  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4696  3-methyladenine DNA glycosylase  48.2 
 
 
229 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4987  hypothetical protein  48.5 
 
 
243 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0127  3-methyladenine DNA glycosylase  48.65 
 
 
229 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4389  3-methyladenine DNA glycosylase  48.65 
 
 
229 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4214  methyladenine glycosylase  48.65 
 
 
229 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4253  3-methyladenine DNA glycosylase  48.65 
 
 
229 aa  227  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3866  3-methyladenine DNA glycosylase  45.74 
 
 
228 aa  224  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0029  3-methyladenine DNA glycosylase  46.4 
 
 
229 aa  223  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176771  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0129  3-methyladenine DNA glycosylase  46.4 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310966  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0150  3-methyladenine DNA glycosylase  45.95 
 
 
229 aa  210  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2960  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  42.58 
 
 
223 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208736  normal  0.0259556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1642  hypothetical protein  41.55 
 
 
223 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4075  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  43.06 
 
 
223 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1244  DNA-glycosylase  41.55 
 
 
223 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48860  hypothetical protein  41.2 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00328607  hitchhiker  0.0000000197287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1204  DNA-glycosylase  40.64 
 
 
223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4231  hypothetical protein  41.9 
 
 
224 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359508  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4185  hypothetical protein  40.28 
 
 
223 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3704  hypothetical protein  40.19 
 
 
223 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1685  hypothetical protein  38.76 
 
 
223 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33200  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  39.71 
 
 
223 aa  167  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0280  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  37.05 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.579527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1166  hypothetical protein  38.91 
 
 
226 aa  165  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159746  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0212  putative DNA glycosylase protein  39.37 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2049  hypothetical protein  37.44 
 
 
222 aa  152  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.443421 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1573  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.67 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0730  3-methyladenine DNA glycosylase  26.75 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.46 
 
 
198 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1297  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.96 
 
 
179 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.46 
 
 
198 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  25.6 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.95 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  25.6 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  25.6 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  26.95 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  26.95 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  25.6 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0938  methyladenine glycosylase  32.89 
 
 
180 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.245904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  28.16 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0241  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.42 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  26.95 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2095  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.36 
 
 
183 aa  52  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.61 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.21 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30 
 
 
196 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.91 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1094  methyladenine glycosylase  32.89 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.91 
 
 
186 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0235  methyladenine glycosylase  25.45 
 
 
183 aa  48.9  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  24.83 
 
 
210 aa  48.9  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.63 
 
 
201 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.63 
 
 
201 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.66 
 
 
193 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.53 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.51 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.67 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.5 
 
 
199 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01997  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.52 
 
 
190 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.68 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.38 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.15 
 
 
206 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  25.27 
 
 
190 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3455  methyladenine glycosylase  27.47 
 
 
183 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0251027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.68 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  23.2 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  23.2 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  23.2 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.85 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  28.57 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.67 
 
 
214 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  23.2 
 
 
200 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.95 
 
 
191 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0062  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40 
 
 
183 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000318334 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07860  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.46 
 
 
249 aa  45.4  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  23.57 
 
 
190 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00110  DNA-3-methyladenine glycosidase I  32.5 
 
 
183 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40 
 
 
183 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0674727  hitchhiker  0.0000000000856753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.14 
 
 
194 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.32 
 
 
200 aa  45.1  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.26 
 
 
186 aa  45.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0010  DNA-3-methyladenine glycosidase I  32.5 
 
 
183 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.55 
 
 
243 aa  45.1  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.11 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0477  3-methyladenine DNA glycosylase  29.07 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0571733  normal  0.984687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0664  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.28 
 
 
197 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.32 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00120  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.86 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0272  50S ribosomal protein L24 (BL23; 12 kDa DNA-binding protein; HPB12)  28.05 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.08 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0684  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.82 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>