215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1685 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1685  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3704  hypothetical protein  94.17 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4231  hypothetical protein  78.57 
 
 		 224 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359508  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1642  hypothetical protein  77.13 
 
 		 223 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1204  DNA-glycosylase  77.13 
 
 		 223 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1244  DNA-glycosylase  76.68 
 
 		 223 aa  370  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4075  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  77.13 
 
 		 223 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2960  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  73.99 
 
 		 223 aa  363  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208736  normal  0.0259556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48860  hypothetical protein  70.85 
 
 		 223 aa  347  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00328607  hitchhiker  0.0000000197287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4185  hypothetical protein  70.4 
 
 		 223 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33200  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  69.06 
 
 		 223 aa  335  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1166  hypothetical protein  49.76 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159746  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3551  3-methyladenine DNA glycosylase  41.89 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4208  hypothetical protein  39.82 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0029  3-methyladenine DNA glycosylase  38.29 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0280  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  39.44 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.579527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03491  3-methyl-adenine DNA glycosylase  40.48 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3839  3-methyladenine DNA glycosylase  42.38 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3932  3-methyladenine DNA glycosylase  41.9 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4048  3-methyladenine DNA glycosylase  41.43 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2831  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.76 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.899123  normal  0.113104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3866  3-methyladenine DNA glycosylase  40.28 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02522  3-methyl-adenine DNA glycosylase  39.9 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003561  hypothetical protein  39.9 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4696  3-methyladenine DNA glycosylase  40.95 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4062  3-methyladenine DNA glycosylase  38.76 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4987  hypothetical protein  38.86 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4214  methyladenine glycosylase  39.52 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0127  3-methyladenine DNA glycosylase  39.52 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4389  3-methyladenine DNA glycosylase  39.52 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4253  3-methyladenine DNA glycosylase  39.05 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0212  putative DNA glycosylase protein  35.27 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0150  3-methyladenine DNA glycosylase  41.34 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0129  3-methyladenine DNA glycosylase  41.67 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2049  hypothetical protein  39.6 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.443421 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1722  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.7 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1756  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.7 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.792087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.48 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.279857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  36.46 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  36.46 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  36.46 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  36.46 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00010  constitutive 3-methyl-adenine DNA glycosylase I  40.91 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  36.46 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  36.46 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  36.46 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.33 
 
 		 190 aa  62  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.46 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.25 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  36.17 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.94 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.87 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.65 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.71 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.04 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  37.25 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.32 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  34.74 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0467  yggt family protein  37.93 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.2 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2095  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.65 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.96 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.67 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.87 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0348853  normal  0.0800012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.42 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.08 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.8 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  30.3 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.79 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  32.98 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.69 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.13 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0062  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.93 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000318334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  32.98 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0312  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.19 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.547447  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.37 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  32.98 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.08 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0674727  hitchhiker  0.0000000000856753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  32.98 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.71 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  30.3 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37 
 
 		 190 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.65 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.13 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.69 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.18 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.44 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.8 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.68 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.55 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0477  3-methyladenine DNA glycosylase  33.71 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0571733  normal  0.984687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.18 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.33 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.59 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  31.91 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.47 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.99 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.38 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.52 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.97 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>