75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4987 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4987  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4208  hypothetical protein  58.12 
 
 		 235 aa  280  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03491  3-methyl-adenine DNA glycosylase  52.56 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02522  3-methyl-adenine DNA glycosylase  51.46 
 
 		 228 aa  244  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003561  hypothetical protein  50.63 
 
 		 228 aa  241  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3551  3-methyladenine DNA glycosylase  50.63 
 
 		 228 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3932  3-methyladenine DNA glycosylase  48.73 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3839  3-methyladenine DNA glycosylase  48.31 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0029  3-methyladenine DNA glycosylase  47.03 
 
 		 229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4696  3-methyladenine DNA glycosylase  48.31 
 
 		 229 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4048  3-methyladenine DNA glycosylase  48.73 
 
 		 229 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3866  3-methyladenine DNA glycosylase  46.86 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2831  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.5 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.899123  normal  0.113104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4062  3-methyladenine DNA glycosylase  46.61 
 
 		 229 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4253  3-methyladenine DNA glycosylase  46.19 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0127  3-methyladenine DNA glycosylase  45.76 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4214  methyladenine glycosylase  45.76 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0150  3-methyladenine DNA glycosylase  47.46 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4389  3-methyladenine DNA glycosylase  45.76 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0129  3-methyladenine DNA glycosylase  45.76 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0280  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  41.85 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.579527  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2960  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  40.71 
 
 		 223 aa  178  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208736  normal  0.0259556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1244  DNA-glycosylase  40.71 
 
 		 223 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1204  DNA-glycosylase  40.27 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33200  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  39.38 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1642  hypothetical protein  40.27 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48860  hypothetical protein  42.15 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00328607  hitchhiker  0.0000000197287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4075  3-methyladenine DNA glycosylase-like protein  40.27 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4231  hypothetical protein  43.09 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359508  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4185  hypothetical protein  40.81 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1685  hypothetical protein  38.86 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3704  hypothetical protein  37.99 
 
 		 223 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0212  putative DNA glycosylase protein  36.96 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1166  hypothetical protein  33.76 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159746  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2049  hypothetical protein  36.98 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.443421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.33 
 
 		 191 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1297  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.72 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.33 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00010  constitutive 3-methyl-adenine DNA glycosylase I  33.63 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2095  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.87 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1573  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.17 
 
 		 177 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0730  3-methyladenine DNA glycosylase  25.77 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.01 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.61 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.68 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  23.28 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3910  methyladenine glycosylase  33.33 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0771426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8424  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.01 
 
 		 185 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.719422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.89 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.32 
 
 		 186 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.81 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.01 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.44 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3455  methyladenine glycosylase  30.86 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0251027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  32.35 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.66 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  25.98 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  22.95 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07860  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30.56 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.89 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  30 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.85 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.69 
 
 		 200 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.94 
 
 		 187 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.78 
 
 		 198 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  29.87 
 
 		 194 aa  42.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.98 
 
 		 200 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.98 
 
 		 200 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0477  3-methyladenine DNA glycosylase  27.27 
 
 		 196 aa  42  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0571733  normal  0.984687 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  26.98 
 
 		 200 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.12 
 
 		 190 aa  42  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.46 
 
 		 201 aa  42  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.41 
 
 		 197 aa  42  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  24.67 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  27.86 
 
 		 208 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>