256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1229 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1229  DNA-3-methyladenine glycosylase I, putative  100 
 
 		 186 aa  390  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.164878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1756  DNA-3-methyladenine glycosylase I  75.14 
 
 		 186 aa  298  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.792087  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1722  DNA-3-methyladenine glycosylase I  75.14 
 
 		 186 aa  298  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.39 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  41.4 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  41.4 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  41.4 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  41.4 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.07 
 
 		 210 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  41.4 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.4 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  41.4 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  41.4 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.89 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.53 
 
 		 190 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.89 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.89 
 
 		 198 aa  170  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.63 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.94 
 
 		 190 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.94 
 
 		 191 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  40.32 
 
 		 187 aa  168  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.94 
 
 		 191 aa  168  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.11 
 
 		 220 aa  167  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.32 
 
 		 204 aa  167  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.89 
 
 		 186 aa  167  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.99 
 
 		 191 aa  166  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  41.62 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.55 
 
 		 196 aa  166  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  40.76 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  41.62 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.57 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  41.3 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  40.76 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  41.08 
 
 		 193 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.22 
 
 		 187 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.22 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  42.37 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.11 
 
 		 190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.68 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.78 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.11 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.76 
 
 		 195 aa  162  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.34 
 
 		 190 aa  161  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.4 
 
 		 194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.66 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  37.99 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.11 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.66 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.08 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  38.98 
 
 		 189 aa  158  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.55 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.78 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.55 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23730  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.56 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00337474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.11 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.83 
 
 		 194 aa  158  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.99 
 
 		 188 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.99 
 
 		 188 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.64 
 
 		 202 aa  157  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.22 
 
 		 190 aa  157  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.21 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0312  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.71 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.547447  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.22 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.2 
 
 		 198 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  38.8 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.68 
 
 		 190 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0027  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.55 
 
 		 189 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.98 
 
 		 191 aa  154  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.42 
 
 		 209 aa  154  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  38.2 
 
 		 189 aa  154  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.87 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.64 
 
 		 221 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.08 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.85 
 
 		 209 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.11 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.64 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.11 
 
 		 214 aa  151  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.99 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.31 
 
 		 208 aa  151  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.79 
 
 		 200 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.29 
 
 		 213 aa  151  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.79 
 
 		 200 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.79 
 
 		 200 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.11 
 
 		 183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.99 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.43 
 
 		 195 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.85 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.26 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1933  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.02 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.67 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.44 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.79 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.79 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.2 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.43 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.87 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.72 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.11 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.87 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.79 
 
 		 200 aa  147  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.899334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>