More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1880 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1880  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  291  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1881  hypothetical protein  39.73 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00634101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.55 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0303  type IV pilin  30.77 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.06 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  32 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  36.08 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  51.16 
 
 		 188 aa  53.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  34.85 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  27.66 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  31.21 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  30.14 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  30.93 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  45.16 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  31.19 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  41.94 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  31.82 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  42.25 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  30.69 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  32.73 
 
 		 252 aa  51.2  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  26.53 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  58.14 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  46.81 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  33.33 
 
 		 176 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  33.33 
 
 		 176 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  41.18 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  44.44 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  35.09 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  23.26 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  35.71 
 
 		 182 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  38.96 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.53 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  35.07 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  29.57 
 
 		 173 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.86 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  36.84 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.03 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  27.97 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.07 
 
 		 193 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  48.08 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  30.51 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  41.27 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.65 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  31.58 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.62 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  37.5 
 
 		 323 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  34.48 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0536  hypothetical protein  39.22 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.84 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.44 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.84 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  25.19 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  33.85 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1273  competence protein ComGC  42.62 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0185017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  42.11 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  38.33 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2670  hypothetical protein  28.75 
 
 		 319 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.402789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.02 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  35.21 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  33.66 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.82 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  34.88 
 
 		 144 aa  48.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  33.04 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  34.88 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.08 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  37.29 
 
 		 338 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  40.58 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  30.67 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.91 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  40.35 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.03 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2475  N-terminal methylation site  28.8 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  49.06 
 
 		 567 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  35.09 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  28.33 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  33.72 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  33.72 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  32.79 
 
 		 349 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  29.25 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  35.38 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  38.89 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  27.06 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  37.93 
 
 		 213 aa  47.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.836377 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  43.1 
 
 		 548 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  42.86 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  27.47 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  33.72 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  30.77 
 
 		 218 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  38.1 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  25.53 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>