155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4472 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4481  Extracellular ligand-binding receptor  68.96 
 
 
686 aa  856    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4326  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  69.55 
 
 
686 aa  860    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4462  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  68.81 
 
 
686 aa  853    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4472  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
688 aa  1353    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0704928 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  28.46 
 
 
627 aa  194  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.84 
 
 
677 aa  186  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  27.58 
 
 
643 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3863  Extracellular ligand-binding receptor  30.69 
 
 
651 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0863227 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.47 
 
 
676 aa  96.3  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  21.88 
 
 
375 aa  77  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  21.18 
 
 
386 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  20.05 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  22.46 
 
 
404 aa  72  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  21.67 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  21.72 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2555  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.7 
 
 
606 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305617 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  21.9 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  21.92 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  21.41 
 
 
402 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  23.19 
 
 
419 aa  64.3  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  21.11 
 
 
390 aa  64.3  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  20.87 
 
 
391 aa  62.8  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  20.6 
 
 
398 aa  62  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
395 aa  61.6  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  21.08 
 
 
381 aa  61.2  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
397 aa  61.2  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0302  hypothetical protein  23.69 
 
 
705 aa  60.8  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0292766  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  26.16 
 
 
380 aa  60.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  21.48 
 
 
378 aa  60.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.4 
 
 
396 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  19.52 
 
 
387 aa  59.7  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  22.7 
 
 
451 aa  59.7  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 
370 aa  59.3  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
370 aa  58.9  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 
369 aa  58.5  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  24.21 
 
 
390 aa  58.2  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  27.19 
 
 
381 aa  57.4  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1163  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.58 
 
 
371 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.860982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
383 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1490  Extracellular ligand-binding receptor  23.78 
 
 
372 aa  56.6  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000299787  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 
383 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1038  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.58 
 
 
371 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0869251  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  28.35 
 
 
631 aa  57  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
370 aa  57  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2361  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.44 
 
 
385 aa  56.2  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  28.73 
 
 
625 aa  56.2  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.91 
 
 
383 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  22.95 
 
 
376 aa  56.2  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  23.23 
 
 
413 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2152  hypothetical protein  24.6 
 
 
451 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 
406 aa  55.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 
397 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 
402 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 
397 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  30 
 
 
621 aa  54.7  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  20.79 
 
 
391 aa  54.7  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  22.34 
 
 
376 aa  54.7  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 
339 aa  54.3  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.86 
 
 
397 aa  54.3  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  23.19 
 
 
449 aa  54.3  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 
397 aa  53.9  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  24.31 
 
 
376 aa  53.5  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1110  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  21.74 
 
 
370 aa  53.5  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
397 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
378 aa  53.5  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
382 aa  53.9  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  20.29 
 
 
394 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  20.43 
 
 
384 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  27.23 
 
 
824 aa  53.5  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 
373 aa  53.5  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  19.95 
 
 
371 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 
377 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  25.43 
 
 
402 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  29.35 
 
 
378 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
382 aa  52.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2836  hypothetical protein  21.54 
 
 
775 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 
377 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  24.51 
 
 
421 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0678  Extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
476 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 
404 aa  51.6  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
396 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0770  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.78 
 
 
369 aa  51.6  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.132066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.04 
 
 
385 aa  51.2  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1162  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.78 
 
 
369 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.438916  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  25.19 
 
 
420 aa  51.2  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1037  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.78 
 
 
369 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.148346  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 
402 aa  51.2  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1111  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.22 
 
 
371 aa  50.8  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  27.23 
 
 
384 aa  50.8  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 
450 aa  50.8  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  26.24 
 
 
628 aa  50.8  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  24.64 
 
 
397 aa  50.8  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  22.73 
 
 
405 aa  50.8  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
396 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 
386 aa  50.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  24.82 
 
 
403 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
396 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32 
 
 
386 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  24.82 
 
 
401 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>