110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0185 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  100 
 
 		 625 aa  1258    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  32.38 
 
 		 629 aa  281  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  32.88 
 
 		 604 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 604 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  31.12 
 
 		 631 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  31.85 
 
 		 604 aa  220  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  31.64 
 
 		 603 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  31.69 
 
 		 604 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  33.1 
 
 		 596 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  32.07 
 
 		 602 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  34.13 
 
 		 628 aa  204  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  31.7 
 
 		 605 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  31.51 
 
 		 605 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  31.37 
 
 		 605 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  29.06 
 
 		 603 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  31.37 
 
 		 605 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  27.66 
 
 		 661 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  33.49 
 
 		 635 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  29.06 
 
 		 603 aa  192  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13140  LppC lipoprotein  30.62 
 
 		 607 aa  191  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2282  putative lipoprotein-like protein  28.14 
 
 		 510 aa  162  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  27.93 
 
 		 603 aa  161  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  32.07 
 
 		 396 aa  157  6e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  32.07 
 
 		 394 aa  157  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  26.2 
 
 		 627 aa  156  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  29.81 
 
 		 617 aa  156  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  26.16 
 
 		 628 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4099  LppC family lipoprotein  26.41 
 
 		 634 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  26.09 
 
 		 627 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4069  LppC family lipoprotein  26.11 
 
 		 634 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  25.95 
 
 		 619 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  26.71 
 
 		 616 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4187  LppC family lipoprotein  26.11 
 
 		 634 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3989  LppC family lipoprotein  26.26 
 
 		 634 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  26.66 
 
 		 595 aa  148  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  25 
 
 		 626 aa  148  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  25.78 
 
 		 607 aa  146  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0676  LppC family lipoprotein  28.57 
 
 		 705 aa  139  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  25.47 
 
 		 603 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  23.93 
 
 		 634 aa  137  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  24.53 
 
 		 653 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  26.45 
 
 		 672 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3624  LppC family lipoprotein  25.85 
 
 		 680 aa  134  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1177  LppC family lipoprotein  23.7 
 
 		 677 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.055728 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0740  LppC precursor  24.16 
 
 		 604 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164476  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  25.82 
 
 		 672 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0227  LppC family lipoprotein  23.56 
 
 		 634 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.238094 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  24.72 
 
 		 555 aa  128  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3453  LppC superfamily  26.61 
 
 		 680 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4336  LppC family lipoprotein  25.53 
 
 		 674 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765962  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3522  LppC superfamily  26.31 
 
 		 680 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3619  LppC family protein  26.31 
 
 		 680 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3559  LppC superfamily  26.31 
 
 		 680 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3451  LppC superfamily  26.31 
 
 		 680 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0252  LppC family lipoprotein  24.05 
 
 		 624 aa  123  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0475  putative LppC lipoprotein  26.37 
 
 		 689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0539  LppC family lipoprotein  26.37 
 
 		 657 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  24.41 
 
 		 612 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  24.41 
 
 		 612 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1120  hypothetical protein  26.2 
 
 		 689 aa  117  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  24.85 
 
 		 666 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0590  LppC family lipoprotein  28.01 
 
 		 573 aa  110  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  28.12 
 
 		 621 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2654  putative lipoprotein LppC  23.55 
 
 		 603 aa  107  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3629  putative lipoprotein  25.24 
 
 		 678 aa  105  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  26.21 
 
 		 576 aa  105  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3584  LppC family lipoprotein  29.06 
 
 		 704 aa  101  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3782  LppC family lipoprotein  29.46 
 
 		 682 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0551  LppC family lipoprotein  28.04 
 
 		 678 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3442  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 678 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4466  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 678 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3339  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 678 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03014  hypothetical protein  28.04 
 
 		 678 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0558  LppC family lipoprotein  28.04 
 
 		 678 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02965  hypothetical protein  28.04 
 
 		 678 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3625  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 678 aa  89.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1749  hypothetical protein  28.8 
 
 		 576 aa  89  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3693  LppC putative lipoprotein  25.41 
 
 		 658 aa  88.2  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1675  LppC family lipoprotein  28.48 
 
 		 576 aa  86.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4432  hypothetical protein  22.87 
 
 		 721 aa  81.6  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  21.65 
 
 		 617 aa  80.5  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1694  putative lipoprotein-like  22.13 
 
 		 525 aa  72.8  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.97529  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  31.22 
 
 		 356 aa  70.5  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.45 
 
 		 677 aa  60.8  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  25.85 
 
 		 627 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  23.43 
 
 		 643 aa  55.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3694  hypothetical protein  29.89 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  29.88 
 
 		 402 aa  53.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  26.26 
 
 		 407 aa  50.4  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0026  Extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 		 398 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3138  hypothetical protein  27.35 
 
 		 419 aa  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0472  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 399 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 		 421 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 399 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 399 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  28.97 
 
 		 403 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>