57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2555 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2555  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 		 606 aa  1147    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 		 643 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  29.97 
 
 		 627 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4481  Extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 		 686 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4326  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.71 
 
 		 686 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21413  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.86 
 
 		 676 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4462  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.83 
 
 		 686 aa  77.4  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395113  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.15 
 
 		 677 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4472  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.86 
 
 		 688 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0704928 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  23.34 
 
 		 381 aa  60.1  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  29.84 
 
 		 635 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3863  Extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 		 651 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0863227 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  35.93 
 
 		 631 aa  55.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  30.69 
 
 		 824 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  26.02 
 
 		 626 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  28.21 
 
 		 629 aa  54.7  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 356 aa  53.9  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2873  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 394 aa  54.3  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1022  hypothetical protein  24.22 
 
 		 693 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.515866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  30.41 
 
 		 603 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  32.64 
 
 		 602 aa  52  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  22.03 
 
 		 394 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 		 427 aa  51.2  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 402 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  37.5 
 
 		 376 aa  50.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  25.68 
 
 		 603 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  26.58 
 
 		 653 aa  48.9  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  28.9 
 
 		 603 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  23.2 
 
 		 399 aa  48.9  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  29.31 
 
 		 378 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  29.31 
 
 		 378 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  28.16 
 
 		 378 aa  47.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  23.26 
 
 		 395 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  21.48 
 
 		 398 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  22.49 
 
 		 383 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.34 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  24.17 
 
 		 395 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 		 373 aa  46.2  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0718  Extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 		 412 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 440 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 387 aa  45.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  28.41 
 
 		 604 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  25.18 
 
 		 420 aa  45.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.41 
 
 		 395 aa  44.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  28.4 
 
 		 625 aa  44.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  23.3 
 
 		 370 aa  44.3  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  25 
 
 		 402 aa  44.3  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  25.67 
 
 		 616 aa  44.3  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 		 380 aa  44.3  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0570  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.58 
 
 		 394 aa  44.3  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.98 
 
 		 395 aa  43.9  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  27.92 
 
 		 595 aa  43.9  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 		 419 aa  43.9  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  27.84 
 
 		 604 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  25.4 
 
 		 555 aa  43.9  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>